RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540683.1

CDCA3-208, Transcript of cell division cycle associated 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDCA3, Length 985 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3-208ENST00000540683 SPATA21Q7Z572 469 aa9.01□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 COMTD1Q86VU5 262 aa9.01□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 MICU2Q8IYU8 434 aa9.01□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa9.01□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 SLC22A24Q8N4F4 322 aa9.01□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 ZNF525Q8N782 197 aa9.01□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 SNX33Q8WV41 574 aa9.01□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 TMEM54Q969K7 222 aa9.01□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 TPD52L3Q96J77 140 aa9.01□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 PRRC1Q96M27 445 aa9.01□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 ZNF583Q96ND8 569 aa9.01□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 RBP7Q96R05 134 aa9.01□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 WACQ9BTA9 647 aa9.01□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 EMC6Q9BV81 110 aa9.01□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 BCL2L14Q9BZR8 327 aa9.01□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 ANKRD19PQ9H560 264 aa9.01□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 RNF121Q9H920 327 aa9.01□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 B3GNT2Q9NY97 397 aa9.01□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa9.01□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 SEC14L4Q9UDX3 406 aa9.01□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 RPS6KA6Q9UK32 745 aa9.01□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa9□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 DHHO43323 396 aa9□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 SASH3O75995 380 aa9□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 HLA-HP01893 362 aa9□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 PGA4P0DJD7 388 aa9□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 PGA3P0DJD8 388 aa9□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 HLA-DOBP13765 273 aa9□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 B4GALT1P15291 398 aa9□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 MDH1P40925 334 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 CHN2P52757 468 aa9□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 TEKQ02763 1124 aa9□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 THEM4Q5T1C6 240 aa9□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 FAM166AQ6J272 317 aa9□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 ARL9Q6T311 187 aa9□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 FKBP9P1Q75LS8 142 aa9□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 SLC16A14Q7RTX9 510 aa9□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 HIPK1Q86Z02 1210 aa9□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 TEX29Q8N6K0 151 aa9□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 HPS1Q92902 700 aa9□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 TXNDC15Q96J42 360 aa9□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 ALG12Q9BV10 488 aa9□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 NELFAQ9H3P2 528 aa9□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 CDH20Q9HBT6 801 aa9□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 NOX3Q9HBY0 568 aa9□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa9□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 TMEM38BQ9NVV0 291 aa9□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 NDE1Q9NXR1 346 aa9□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 TAS2R5Q9NYW4 299 aa9□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 KCNS2Q9ULS6 477 aa9□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 TMEM5Q9Y2B1 443 aa9□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 JMJD1CQ15652 2540 aa9□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 FXYD1O00168 92 aa8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 AHCYL1O43865 530 aa8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 NDUFS7O75251 213 aa8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 SNAP29O95721 258 aa8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 QDPRP09417 244 aa8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 SAGP10523 405 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 ZNF35P13682 527 aa8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 APEHP13798 732 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 DAOP14920 347 aa8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 ACADSP16219 412 aa8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 ITGA2P17301 1181 aa8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 PTNP21246 168 aa8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 TUBG1P23258 451 aa8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 VAMP1P23763 118 aa8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 CALCRP30988 508 aa8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 APLNRP35414 380 aa8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 THBS2P35442 1172 aa8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 THBS4P35443 961 aa8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 LIPAP38571 399 aa8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 NR4A2P43354 598 aa8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 GIPRP48546 466 aa8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 SMIM11AP58511 58 aa8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 TUBA1BP68363 451 aa8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 TUBA4AP68366 448 aa8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 GUCY1A3Q02108 690 aa8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 HSF2Q03933 536 aa8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 TRAM2Q15035 370 aa8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 CARTPTQ16568 116 aa8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 MST1LQ2TV78 715 aa8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 PCGF3Q3KNV8 242 aa8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 IFI44LQ53G44 452 aa8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 ALG10Q5BKT4 473 aa8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 C6orf52Q5T4I8 152 aa8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 KRT80Q6KB66 452 aa8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 TUBA1AQ71U36 451 aa8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 SLC30A7Q8NEW0 376 aa8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 NOXO1Q8NFA2 376 aa8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-208ENST00000540683 C11orf40Q8WZ69 217 aa8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76 ms