RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494037.1

TSPAN7-208, Transcript of tetraspanin 7, humanhuman

TSL 4

Gene TSPAN7, Length 575 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN7-208ENST00000494037 ZNF442Q9H7R0 627 aa7.16□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 TMEM38BQ9NVV0 291 aa7.16□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 RHCGQ9UBD6 479 aa7.16□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 ABCD2Q9UBJ2 740 aa7.16□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 ADAM21Q9UKJ8 722 aa7.16□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 MED31Q9Y3C7 131 aa7.16□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa7.16□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa7.15□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 A0A1W2PRG6 482 aa7.15□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 TMEM129A0AVI4 362 aa7.15□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 ATP8B1O43520 1251 aa7.15□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 TRMUO75648 421 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 PRSS23O95084 383 aa7.15□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 UBL3O95164 117 aa7.15□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 SLC2A10O95528 541 aa7.15□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 RAB36O95755 333 aa7.15□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 F12P00748 615 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 SERPINA1P01009 418 aa7.15□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 IFNW1P05000 195 aa7.15□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 QDPRP09417 244 aa7.15□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 IFI30P13284 250 aa7.15□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 ZNF35P13682 527 aa7.15□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 SLC25A16P16260 332 aa7.15□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 NCK1P16333 377 aa7.15□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 NPR2P20594 1047 aa7.15□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 MAKP20794 623 aa7.15□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 DRD4P21917 467 aa7.15□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 NR4A1P22736 598 aa7.15□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 PPOXP50336 477 aa7.15□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 CLRN1P58418 232 aa7.15□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 DSCR9P59020 149 aa7.15□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 RAB1AP62820 205 aa7.15□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 PPP2R2BQ00005 443 aa7.15□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 FMODQ06828 376 aa7.15□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 ST3GAL3Q11203 375 aa7.15□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 DAG1Q14118 895 aa7.15□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 RAB39AQ14964 217 aa7.15□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 HIST3H3Q16695 136 aa7.15□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 TMEM249Q2WGJ8 235 aa7.15□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 IFI44LQ53G44 452 aa7.15□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 ARMC4Q5T2S8 1044 aa7.15□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 CBLL1Q75N03 491 aa7.15□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 NRMQ8IXM6 262 aa7.15□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 SLC22A24Q8N4F4 322 aa7.15□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 SYT14Q8NB59 555 aa7.15□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 OR4K5Q8NGD3 323 aa7.15□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 LIPHQ8WWY8 451 aa7.15□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 LZICQ8WZA0 190 aa7.15□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 MCHR2Q969V1 340 aa7.15□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 EFCAB1Q9HAE3 211 aa7.15□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 INIPQ9NRY2 104 aa7.15□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 HIF3AQ9Y2N7 669 aa7.15□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 AP3M1Q9Y2T2 418 aa7.15□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 FKBP7Q9Y680 259 aa7.15□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 TRAV27A0A087WT01 109 aa7.14□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 NPIPB13A6NJU9 1138 aa7.14□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 VWC2LB2RUY7 222 aa7.14□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 NPIPB4C9JG80 1138 aa7.14□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 GSTA4O15217 222 aa7.14□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 SNX3O60493 162 aa7.14□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 TP53P04637 393 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 CSF3P09919 207 aa7.14□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 OR8G3PP0DMU2 310 aa7.14□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 ACADSP16219 412 aa7.14□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 CDAP32320 146 aa7.14□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 LSP1P33241 339 aa7.14□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 PDLIM4P50479 330 aa7.14□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 DAP3P51398 398 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 GYS2P54840 703 aa7.14□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 PSME3P61289 254 aa7.14□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 FHL1Q13642 323 aa7.14□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 LAPTM4AQ15012 233 aa7.14□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 TRAM2Q15035 370 aa7.14□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 CARTPTQ16568 116 aa7.14□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 FXNQ16595 210 aa7.14□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 ALG10Q5BKT4 473 aa7.14□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 C10orf128Q5T292 105 aa7.14□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 C6orf52Q5T4I8 152 aa7.14□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 IGFN1Q86VF2 1251 aa7.14□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 FAM86B1Q8N7N1 296 aa7.14□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 CLDN22Q8N7P3 220 aa7.14□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 LRRC75AQ8NAA5 344 aa7.14□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 IL17RDQ8NFM7 739 aa7.14□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 OR13C2Q8NGS9 318 aa7.14□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 FAM162AQ96A26 154 aa7.14□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 NABP1Q96AH0 204 aa7.14□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms