RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493967.1

PATJ-211, Transcript of PATJ, crumbs cell polarity complex component, humanhuman

TSL 2

Gene PATJ, Length 574 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATJ-211ENST00000493967 GSG1Q2KHT4 349 aa6.52□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 IQCCQ4KMZ1 466 aa6.52□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 FGD3Q5JSP0 725 aa6.52□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 AGAP6Q5VW22 663 aa6.52□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 PODNL1Q6PEZ8 512 aa6.52□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 VHLLQ6RSH7 139 aa6.52□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 PRSS57Q6UWY2 283 aa6.52□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 RINLQ6ZS11 566 aa6.52□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 ZNF627Q7L945 461 aa6.52□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 RRM2BQ7LG56 351 aa6.52□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 OAFQ86UD1 273 aa6.52□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 SKA3Q8IX90 412 aa6.52□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 FBXL14Q8N1E6 418 aa6.52□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 CLDN22Q8N7P3 220 aa6.52□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 FAM169BQ8N8A8 192 aa6.52□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 LRRC75AQ8NAA5 344 aa6.52□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 NOXO1Q8NFA2 376 aa6.52□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 OR52J3Q8NH60 311 aa6.52□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 FGFBP3Q8TAT2 258 aa6.52□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 MCHR2Q969V1 340 aa6.52□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 PYURFQ96I23 114 aa6.52□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 NSMCE2Q96MF7 247 aa6.52□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa6.52□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 SEPHS2Q99611 448 aa6.52□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 SMR3AQ99954 134 aa6.52□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 KCNS3Q9BQ31 491 aa6.52□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 KATNB1Q9BVA0 655 aa6.52□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 CACNG6Q9BXT2 260 aa6.52□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 CBLN4Q9NTU7 201 aa6.52□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 B3GNT2Q9NY97 397 aa6.52□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 ZNF224Q9NZL3 707 aa6.52□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 ADAM21Q9UKJ8 722 aa6.52□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa6.51□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa6.51□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa6.51□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 A0A1W2PRQ8 180 aa6.51□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 H7C1Q1 480 aa6.51□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 UBL3O95164 117 aa6.51□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 SLC2A10O95528 541 aa6.51□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 IGHV4-39P01824 125 aa6.51□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 SEMG1P04279 462 aa6.51□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 T-ENOLP0DO92 83 aa6.51□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 RHCEP18577 417 aa6.51□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 ATP6V1B2P21281 511 aa6.51□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 PAX7P23759 505 aa6.51□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 ACVR1BP36896 505 aa6.51□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 GIPRP48546 466 aa6.51□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 CTXN1P60606 82 aa6.51□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 RAB1AP62820 205 aa6.51□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 ERVK-25P63136 954 aa6.51□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 HGFACQ04756 655 aa6.51□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 FMODQ06828 376 aa6.51□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 DGCR6Q14129 220 aa6.51□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 SEC23BQ15437 767 aa6.51□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 MST1LQ2TV78 715 aa6.51□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 C3orf36Q3SXR2 165 aa6.51□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 C11orf71Q6IPW1 123 aa6.51□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 ZNF544Q6NX49 715 aa6.51□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 CYP2R1Q6VVX0 501 aa6.51□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa6.51□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 HDDC2Q7Z4H3 204 aa6.51□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 CCDC36Q8IYA8 594 aa6.51□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 CDK20Q8IZL9 346 aa6.51□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 SLC22A24Q8N4F4 322 aa6.51□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 OR4K5Q8NGD3 323 aa6.51□□□□□ -1.37
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PATJ-211ENST00000493967 C18orf12Q96KH6 178 aa6.51□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 ZNF75AQ96N20 296 aa6.51□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 TSPAN32Q96QS1 320 aa6.51□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 SH3GL3Q99963 347 aa6.51□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 GRIP2Q9C0E4 1043 aa6.51□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 TXNIPQ9H3M7 391 aa6.51□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 ANKRD19PQ9H560 264 aa6.51□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 CA10Q9NS85 328 aa6.51□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 TMEM38BQ9NVV0 291 aa6.51□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 RTTNQ86VV8 2226 aa6.51□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP6.51□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 CSPG4Q6UVK1 2322 aa6.5□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 NPIPB13A6NJU9 1138 aa6.5□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 CENPBD1B2RD01 187 aa6.5□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 NPIPB4C9JG80 1138 aa6.5□□□□□ -1.37
PATJ-211ENST00000493967 H7C1C5 153 aa6.5□□□□□ -1.37
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