RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 USF3Q68DE3 2245 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 GADD45GO95257 159 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 HLA-HP01893 362 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 CECR9P0C854 216 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 CAPZA2P47755 286 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 RPL27P61353 136 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 MYBPC1Q00872 1141 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 MDP1Q86V88 176 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 ASB9Q96DX5 294 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 TSPAN32Q96QS1 320 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 KCNK17Q96T54 332 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 GPA33Q99795 319 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 NOX3Q9HBY0 568 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 POU2F3Q9UKI9 436 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 MOKQ9UQ07 419 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 ACOT8O14734 319 aa18.22■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 CD8AP01732 235 aa18.22■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 CELA3BP08861 270 aa18.22■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 PAX1P15863 534 aa18.22■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 RRM2P31350 389 aa18.22■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 ARR3P36575 388 aa18.22■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 ACVR1BP36896 505 aa18.22■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 MAGEA2P43356 314 aa18.22■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 ADAM8P78325 824 aa18.22■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 ZER1Q7Z7L7 766 aa18.22■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 SKA3Q8IX90 412 aa18.22■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 ZNF519Q8TB69 540 aa18.22■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 ZNF75AQ96N20 296 aa18.22■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 DHRS9Q9BPW9 319 aa18.22■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 KATNB1Q9BVA0 655 aa18.22■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 GSX2Q9BZM3 304 aa18.22■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 CXorf56Q9H5V9 222 aa18.22■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 TMEM38BQ9NVV0 291 aa18.22■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 SIGLEC7Q9Y286 467 aa18.22■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 ATP23Q9Y6H3 246 aa18.22■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa18.21■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 OVOL3O00110 214 aa18.21■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 CALCRP30988 508 aa18.21■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 ERVK-25P63136 954 aa18.21■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 NAAAQ02083 359 aa18.21■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 C10orf128Q5T292 105 aa18.21■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 PGM2L1Q6PCE3 622 aa18.21■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 DTX2Q86UW9 622 aa18.21■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa18.21■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 SLC22A24Q8N4F4 322 aa18.21■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 WFDC11Q8NEX6 87 aa18.21■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 FGFBP3Q8TAT2 258 aa18.21■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 MAGIXQ9H6Y5 334 aa18.21■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 HIVEP1P15822 2718 aa18.2■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 UNC119BA6NIH7 251 aa18.2■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 GYG2O15488 501 aa18.2■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 SLC2A10O95528 541 aa18.2■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 CD14P08571 375 aa18.2■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 TTKP33981 857 aa18.2■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 PTH2RP49190 550 aa18.2■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 HMGA2P52926 109 aa18.2■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 FXYD6P3P58550 94 aa18.2■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 FMODQ06828 376 aa18.2■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 PIGFQ07326 219 aa18.2■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 GSG1Q2KHT4 349 aa18.2■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 DNAL1Q4LDG9 190 aa18.2■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 FAM205BPQ63HN1 556 aa18.2■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 CLDN22Q8N7P3 220 aa18.2■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa18.2■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 HTRA1Q92743 480 aa18.2■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 PERPQ96FX8 193 aa18.2■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 BTBD10Q9BSF8 475 aa18.2■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 ALG12Q9BV10 488 aa18.2■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 GRIP2Q9C0E4 1043 aa18.2■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 AURKCQ9UQB9 309 aa18.2■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa18.2■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 ITPR3Q14573 2671 aa18.19■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 A6NIZ1 184 aa18.19■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 KRT36O76013 467 aa18.19■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 NDUFB2O95178 105 aa18.19■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 CRYAAP02489 173 aa18.19■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 PATE4P0C8F1 98 aa18.19■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 OR8G3PP0DMU2 310 aa18.19■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 CD79AP11912 226 aa18.19■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 RPL4P36578 427 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 ZNF84P51523 738 aa18.19■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 RAP1BP61224 184 aa18.19■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 RAB1AP62820 205 aa18.19■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 RAP1AP62834 184 aa18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms