RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477440.6

ARHGEF3-208, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 3

Gene ARHGEF3, Length 587 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-208ENST00000477440 LAMP3Q9UQV4 416 aa22.1■■□□□ 1.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 CENPBD1B2RD01 187 aa22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 E7EQL1 145 aa22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 ACOT8O14734 319 aa22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 IGKV3-15P01624 115 aa22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 IGLV1-44P01699 117 aa22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 HLA-HP01893 362 aa22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 SOD3P08294 240 aa22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 CECR9P0C854 216 aa22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 MAGEA2P43356 314 aa22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 TAF11Q15544 211 aa22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 PGGHGQ32M88 737 aa22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 MDP1Q86V88 176 aa22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 TMEM171Q8WVE6 324 aa22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 HTRA1Q92743 480 aa22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 KCNK17Q96T54 332 aa22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 GPA33Q99795 319 aa22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 KATNB1Q9BVA0 655 aa22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 MOKQ9UQ07 419 aa22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 AURKCQ9UQB9 309 aa22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 SIGLEC7Q9Y286 467 aa22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 SMPD2O60906 423 aa22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 SLC2A10O95528 541 aa22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 CBR1P16152 277 aa22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 PAX7P23759 505 aa22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 ACVR1BP36896 505 aa22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 FMODQ06828 376 aa22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 ZER1Q7Z7L7 766 aa22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 CCDC36Q8IYA8 594 aa22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 CLDN22Q8N7P3 220 aa22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 FAM169BQ8N8A8 192 aa22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 ZNF519Q8TB69 540 aa22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 BTBD10Q9BSF8 475 aa22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 MAGIXQ9H6Y5 334 aa22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 TMEM38BQ9NVV0 291 aa22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 B3GNT2Q9NY97 397 aa22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 PTP4A3O75365 173 aa22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 CD79AP11912 226 aa22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 RPL4P36578 427 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 FXYD6P3P58550 94 aa22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 ERVK-25P63136 954 aa22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 CD47Q08722 323 aa22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 NPRL3Q12980 569 aa22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 BNIP1Q12981 228 aa22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 C3orf36Q3SXR2 165 aa22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 PGM2L1Q6PCE3 622 aa22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 DEPDC4Q8N2C3 294 aa22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 LRGUKQ96M69 825 aa22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 MED13LQ71F56 2210 aa22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 OR10H3O60404 316 aa22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 NAAAQ02083 359 aa22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 PIGFQ07326 219 aa22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 C10orf128Q5T292 105 aa22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 THSD4Q6ZMP0 1018 aa22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 SKA3Q8IX90 412 aa22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 SLC22A24Q8N4F4 322 aa22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 PERPQ96FX8 193 aa22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 IL20RAQ9UHF4 553 aa22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 ATP23Q9Y6H3 246 aa22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 UNC119BA6NIH7 251 aa22.05■■□□□ 1.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 NDUFB2O95178 105 aa22.05■■□□□ 1.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 STAMBPO95630 424 aa22.05■■□□□ 1.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 CD14P08571 375 aa22.05■■□□□ 1.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 CALCRP30988 508 aa22.05■■□□□ 1.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 ARR3P36575 388 aa22.05■■□□□ 1.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 ZNF84P51523 738 aa22.05■■□□□ 1.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 CHRNB3Q05901 458 aa22.05■■□□□ 1.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 GSG1Q2KHT4 349 aa22.05■■□□□ 1.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 FAM205BPQ63HN1 556 aa22.05■■□□□ 1.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 FAM122BQ7Z309 247 aa22.05■■□□□ 1.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 FGFBP3Q8TAT2 258 aa22.05■■□□□ 1.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 Q96M85 177 aa22.05■■□□□ 1.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 SH3GL3Q99963 347 aa22.05■■□□□ 1.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 DHRS9Q9BPW9 319 aa22.05■■□□□ 1.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 ALG12Q9BV10 488 aa22.05■■□□□ 1.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 CXorf56Q9H5V9 222 aa22.05■■□□□ 1.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 TMCC3Q9ULS5 477 aa22.05■■□□□ 1.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 H7C1C5 153 aa22.04■■□□□ 1.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 CD8AP01732 235 aa22.04■■□□□ 1.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 CRYAAP02489 173 aa22.04■■□□□ 1.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 PATE4P0C8F1 98 aa22.04■■□□□ 1.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 OR8G3PP0DMU2 310 aa22.04■■□□□ 1.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 PTH2RP49190 550 aa22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms