RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415409.5

HDAC8-211, Transcript of histone deacetylase 8, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC8, Length 913 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8-211ENST00000415409 SYS1Q8N2H4 156 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 GALNT16Q8N428 558 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 EXD3Q8N9H8 876 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 OR51L1Q8NGJ5 315 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 OR14L1PQ8NHC6 308 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 NDNFQ8TB73 568 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 SNX33Q8WV41 574 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 ZFAND2BQ8WV99 257 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 KCNE4Q8WWG9 221 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 RELTQ969Z4 430 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 MIB2Q96AX9 1013 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 AGAP4Q96P64 663 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 COQ7Q99807 217 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 DCSTAMPQ9H295 470 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 TMEM185BQ9H7F4 350 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 FANCFQ9NPI8 374 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 RASD1Q9Y272 281 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 FKBP7Q9Y680 259 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 EPG5Q9HCE0 2579 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 A0A0G2JMM0 328 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 A0A1W2PPB8 328 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 A0A1W2PRS3 328 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 SLC22A23A1A5C7 686 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 OR2M5A3KFT3 312 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 AQP7P3A6NL99 342 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 FAM171A2A8MVW0 826 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 KIR3DP1A8MWS1 328 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 H7C1C5 153 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 PHYHO14832 338 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 DNPH1O43598 174 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 SELENOFO60613 162 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 SLC16A7O60669 478 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 GPX5O75715 221 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 CLPXO76031 633 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 ALX3O95076 343 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 VAMP5O95183 116 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 WDPCPO95876 746 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 F10P00742 488 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 HLA-DQA2P01906 255 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 OPN1LWP04000 364 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 TACSTD2P09758 323 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 SPTBP11277 2137 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 NR2C1P13056 603 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 IFNGR1P15260 489 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 FOSL1P15407 271 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 CELP19835 753 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 GDF1P27539 372 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 GABRA5P31644 462 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 SOX6P35712 828 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 CRYBB2P43320 205 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 GPR85P60893 370 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 LCN6P62502 163 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF85Q03923 595 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 MELKQ14680 651 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 RTP5Q14D33 572 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 TRAM1Q15629 374 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 PDSS1Q5T2R2 415 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 LINC01590Q5TEZ4 76 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 TMEM225Q6GV28 225 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 SPINK14Q6IE38 97 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 C16orf87Q6PH81 154 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 LINC00696Q6ZRV3 163 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 LINC00299Q6ZSB3 139 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 VASH2Q86V25 355 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 PM20D2Q8IYS1 436 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 OR6V1Q8N148 313 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF485Q8NCK3 441 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 OR2M7Q8NG81 312 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 ZPLD1Q8TCW7 415 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 ASB10Q8WXI3 467 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 TM9SF4Q92544 642 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 C4orf36Q96KX1 117 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 KLHL15Q96M94 604 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 SFXN2Q96NB2 322 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 OXGR1Q96P68 337 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 TSSK2Q96PF2 358 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 RBP7Q96R05 134 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 INTS14Q96SY0 518 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF649Q9BS31 505 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 OR2B2Q9GZK3 357 aa5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.4 ms