RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384526.1

RNU6-880P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 880, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-880P, Length 107 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-880P-201ENST00000384526 MT1XP80297 61 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 RGS1Q08116 209 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 RIPK1Q13546 671 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 HES1Q14469 280 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 POU2AF1Q16633 256 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 PGGHGQ32M88 737 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 SLC16A13Q7RTY0 426 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 SLC26A11Q86WA9 606 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 CCDC83Q8IWF9 413 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 NHLRC2Q8NBF2 726 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 ACTL9Q8TC94 416 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 SLC25A36Q96CQ1 311 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 FAHD2AQ96GK7 314 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 ITCHQ96J02 903 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 ELMO2Q96JJ3 720 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 ZNF488Q96MN9 340 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 C1orf50Q9BV19 199 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 DUSP16Q9BY84 665 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 TSPYL1Q9H0U9 437 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 RNF167Q9H6Y7 350 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 PALMDQ9NP74 551 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 GLRX2Q9NS18 164 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 FAM206AQ9NX38 181 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 COL4A5P29400 1685 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 ASXL3Q9C0F0 2248 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 FHOD3Q2V2M9 1422 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 ARHGEF37A1IGU5 675 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 OOEPA6NGQ2 149 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 A8MWP4 228 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 C15orf65H3BRN8 121 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 UGT1A9O60656 530 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 STAMBPO95630 424 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 NDUFB10O96000 172 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 HLA-DPB1P04440 258 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 HBQ1P09105 142 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 UROSP10746 265 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 CYP2B6P20813 491 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 CMA1P23946 247 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 SERPINB6P35237 376 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 GALR1P47211 349 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 RAD23AP54725 363 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 HERVK_113P63132 956 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 ERVK-8P63133 956 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 IL5RAQ01344 420 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 CCDC70Q6NSX1 233 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 TRAT1Q6PIZ9 186 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 WDFY1Q8IWB7 410 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 NOXO1Q8NFA2 376 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 ZNF681Q96N22 645 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 ERVK-6Q9BXR3 956 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 DSN1Q9H410 356 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 UGT1A7Q9HAW7 530 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 UGT1A10Q9HAW8 530 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 UGT1A8Q9HAW9 530 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 XCL2Q9UBD3 114 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 IKBKGQ9Y6K9 419 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 TANC2Q9HCD6 1990 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 PKDREJQ9NTG1 2253 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 TET3O43151 1660 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 TRAV6A0A075B6T7 132 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 CXCL14O95715 111 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 IGLV3-25P01717 112 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 IGLV7-43P04211 117 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 ANXA3P12429 323 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 ATF6P18850 670 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 MSR1P21757 451 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 ME2P23368 584 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 MPV17P39210 176 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 BDKRB1P46663 353 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 PITPNBP48739 271 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 ACOT2P49753 483 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 RAB40BQ12829 278 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 BIKQ13323 160 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 ADPRMQ3LIE5 342 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 PARP15Q460N3 678 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 FUT11Q495W5 492 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 Q6ZN92 141 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 ZNF493Q6ZR52 646 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-880P-201ENST00000384526 KLHL7Q8IXQ5 586 aa-1.06□□□□□ -2.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms