RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328514.11

GINS3-202, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-202ENST00000328514 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 SLC17A2O00624 439 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 NKX2-2O95096 273 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 RAB3DO95716 219 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 IL2RAP01589 272 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 S100A8P05109 93 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 OR8G3PP0DMU2 310 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 SPP1P10451 314 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 CD34P28906 385 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 POU3F4P49335 361 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 PRPS1P60891 318 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 FGL2Q14314 439 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 DHCR24Q15392 516 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 FDX2Q6P4F2 183 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 IL34Q6ZMJ4 242 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 CDC20BQ86Y33 519 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 KREMEN2Q8NCW0 462 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 OR5AP2Q8NGF4 316 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 OR2G2Q8NGZ5 317 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 ZPLD1Q8TCW7 415 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 ASB12Q8WXK4 309 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 TMEM106AQ96A25 262 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 TM4SF19Q96DZ7 209 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 ZBP1Q9H171 429 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 ADAP2Q9NPF8 381 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 SPHK1Q9NYA1 384 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 A0A087WUJ7 227 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 A0A0A6YYH2 397 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 A6NJ64 397 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 ACTL6AO96019 429 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 MAS1P04201 325 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 CRYBA1P05813 215 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 ABOP16442 354 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 ZBTB25P24278 435 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 RPL4P36578 427 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 P2RY2P41231 377 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 SOX2P48431 317 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 EGR3Q06889 387 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 DMWDQ09019 674 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 MGAT2Q10469 447 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 NR0B2Q15466 257 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 H3F3CQ6NXT2 135 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 FIGNL1Q6PIW4 674 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 DRAM2Q6UX65 266 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 ZNF550Q7Z398 422 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 OR51D1Q8NGF3 324 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 OR1J2Q8NGS2 313 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 ELP5Q8TE02 316 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 FAM3DQ96BQ1 224 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 CTHRC1Q96CG8 243 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 PIK3IP1Q96FE7 263 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 FAHD2AQ96GK7 314 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 PTCHD1Q96NR3 888 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 EGLN1Q9GZT9 426 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 COMMD4Q9H0A8 199 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 TLNRD1Q9H1K6 362 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 ASF1BQ9NVP2 202 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 TMEM72A0PK05 275 aa10.22□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 H0YC42 278 aa10.22□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 CCL16O15467 120 aa10.22□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 PCCBP05166 539 aa10.22□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 ITGA5P08648 1049 aa10.22□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 GABRA3P34903 492 aa10.22□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 BLOC1S1P78537 153 aa10.22□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 RUNX2Q13950 521 aa10.22□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 RAB11BQ15907 218 aa10.22□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 SWI5Q1ZZU3 235 aa10.22□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa10.22□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 C2orf76Q3KRA6 126 aa10.22□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 ZAR1Q86SH2 424 aa10.22□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 SLC25A42Q86VD7 318 aa10.22□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 OR4N5Q8IXE1 308 aa10.22□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 OR6S1Q8NH40 331 aa10.22□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 MITD1Q8WV92 249 aa10.22□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 RNF141Q8WVD5 230 aa10.22□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 LIPHQ8WWY8 451 aa10.22□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa10.22□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa10.22□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 LYRM4Q9HD34 91 aa10.22□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 ACKR4Q9NPB9 350 aa10.22□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 MMP26Q9NRE1 261 aa10.22□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 EML5Q05BV3 1969 aa10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms