RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 VHLP40337 213 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 GIPRP48546 466 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 AQP4P55087 323 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 CLRN1P58418 232 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 RAP1BP61224 184 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 LCN6P62502 163 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 RAP1AP62834 184 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 ADORA2A-AS1P86434 159 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 CDK5Q00535 292 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 RUNX1T1Q06455 604 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP7.54□□□□□ -1.2
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SGMS1-211ENST00000626236 GPR139Q6DWJ6 353 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 ACSM5Q6NUN0 579 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 BTLAQ7Z6A9 289 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 JAZF1Q86VZ6 243 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF100Q8IYN0 542 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 UBE2J2Q8N2K1 259 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 LNX2Q8N448 690 aa7.54□□□□□ -1.2
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SGMS1-211ENST00000626236 ZNF555Q8NEP9 628 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 OR52E2Q8NGJ4 325 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 OR4K13Q8NH42 304 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 OR6X1Q8NH79 312 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF519Q8TB69 540 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 CYGBQ8WWM9 190 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF566Q969W8 418 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 APH1AQ96BI3 265 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 STARD4Q96DR4 205 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 CCDC120Q96HB5 630 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 RDH12Q96NR8 316 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 TEX12Q9BXU0 123 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 GRIP2Q9C0E4 1043 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 SLC25A19Q9HC21 320 aa7.54□□□□□ -1.2
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SGMS1-211ENST00000626236 PROCRQ9UNN8 238 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 RNF6Q9Y252 685 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 RCE1Q9Y256 329 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 RELNP78509 3460 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 RIIAD1A6NNX1 92 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 M0R129 80 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 M0R3G1 203 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 DVL2O14641 736 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 IDH3BO43837 385 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 UPK3AO75631 287 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 KRT33AO76009 404 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF432O94892 652 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 SLC2A10O95528 541 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 TXNDC12O95881 172 aa7.53□□□□□ -1.2
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SGMS1-211ENST00000626236 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
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SGMS1-211ENST00000626236 MTFR2Q6P444 385 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 LEG1Q6P5S2 330 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 IZUMO2Q6UXV1 221 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 TFAP2EQ6VUC0 442 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 PTCHD4Q6ZW05 846 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 ADCK1Q86TW2 530 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 LIX1LQ8IVB5 337 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM123Q8N131 208 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 SDR9C7Q8NEX9 313 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 NOXO1Q8NFA2 376 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 OR6N1Q8NGY5 312 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
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SGMS1-211ENST00000626236 SLC38A2Q96QD8 506 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 NMNAT3Q96T66 252 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 PRRG3Q9BZD7 231 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 RASSF4Q9H2L5 321 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 FN3KQ9H479 309 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 FAM118AQ9NWS6 357 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 TVP23BQ9NYZ1 205 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 UPB1Q9UBR1 384 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 PRSS50Q9UI38 385 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 KLHL21Q9UJP4 597 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 SLC5A6Q9Y289 635 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 GMPPBQ9Y5P6 360 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 ESPL1Q14674 2120 aa7.52□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF462Q96JM2 2506 aa7.52□□□□□ -1.21
SGMS1-211ENST00000626236 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
SGMS1-211ENST00000626236 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa7.52□□□□□ -1.21
SGMS1-211ENST00000626236 PRSS37A4D1T9 235 aa7.52□□□□□ -1.21
SGMS1-211ENST00000626236 OR6C65A6NJZ3 312 aa7.52□□□□□ -1.21
SGMS1-211ENST00000626236 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa7.52□□□□□ -1.21
SGMS1-211ENST00000626236 H0YJX3 145 aa7.52□□□□□ -1.21
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