RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 MED29Q9NX70 200 aa27.68■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 NCOR2Q9Y618 2525 aa27.68■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC22A23A1A5C7 686 aa27.67■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 CYTIPO60759 359 aa27.67■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 SYNGR4O95473 234 aa27.67■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 CLUP10909 449 aa27.67■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 PCMT1P22061 227 aa27.67■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 GSTT1P30711 240 aa27.67■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 ATP6V1E1P36543 226 aa27.67■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 ALDH3B2P48448 385 aa27.67■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa27.67■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 DNM1P34Q6PK57 102 aa27.67■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa27.67■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 FCRLAQ7L513 359 aa27.67■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 ZBTB46Q86UZ6 589 aa27.67■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 PNPLA2Q96AD5 504 aa27.67■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 TXNDC15Q96J42 360 aa27.67■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 SPRR3Q9UBC9 169 aa27.67■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa27.67■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 TRMUO75648 421 aaKnown RBP27.66■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 IGHG1P01857 330 aa27.66■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 GYPBP06028 91 aa27.66■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 SRYQ05066 204 aa27.66■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 IRF3Q14653 427 aa27.66■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 CHMP1BQ7LBR1 199 aa27.66■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 PM20D2Q8IYS1 436 aa27.66■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 WDYHV1Q96HA8 205 aa27.66■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 TUBA1CQ9BQE3 449 aa27.66■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa27.66■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 KLHL13Q9P2N7 655 aa27.66■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP27.66■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa27.66■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa27.65■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF726A6NNF4 738 aa27.65■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 KLK2P20151 261 aa27.65■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 XAF1Q6GPH4 301 aa27.65■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 SARAFQ96BY9 339 aa27.65■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 CRELD1Q96HD1 420 aa27.65■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 PRDM14Q9GZV8 571 aa27.65■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 RACGAP1Q9H0H5 632 aa27.65■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 ACOT13Q9NPJ3 140 aa27.65■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 GTF3C1Q12789 2109 aa27.65■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC35F4A4IF30 521 aa27.64■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF716A6NP11 495 aa27.64■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 H7C1C5 153 aa27.64■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 IGHA1P01876 353 aa27.64■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 MYL12AP19105 171 aa27.64■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 LCN6P62502 163 aa27.64■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 PROKR2Q8NFJ6 384 aa27.64■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 OR51G2Q8NGK0 314 aa27.64■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 RBP7Q96R05 134 aa27.64■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 INPP5EQ9NRR6 644 aa27.64■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 ERGIC3Q9Y282 383 aa27.64■■■□□ 2.02
CAPNS1-206ENST00000588815 SBK2P0C263 348 aa27.64■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 TTKP33981 857 aa27.64■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 THEM4Q5T1C6 240 aa27.64■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 LINC01590Q5TEZ4 76 aa27.64■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 OR6V1Q8N148 313 aa27.64■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 GHDCQ8N2G8 530 aa27.64■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 NUAK2Q9H093 628 aa27.64■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 B9D1Q9UPM9 204 aa27.64■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 RCE1Q9Y256 329 aa27.64■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 MGAQ8IWI9 3026 aa27.63■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 OR14I1A6ND48 311 aa27.63■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 J3QRE1 110 aa27.63■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 PGA4P0DJD7 388 aa27.63■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 PGA3P0DJD8 388 aa27.63■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 CLDN17P56750 224 aa27.63■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 ACTC1P68032 377 aa27.63■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 ACTA1P68133 377 aa27.63■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 RUNX1T1Q06455 604 aa27.63■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa27.63■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 LINC00303Q3SY05 128 aa27.63■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 NOXO1Q8NFA2 376 aa27.63■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 RNF128Q8TEB7 428 aa27.63■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 RORBQ92753 470 aa27.63■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 EMC6Q9BV81 110 aa27.63■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 RNF122Q9H9V4 155 aa27.63■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 ADGRL4Q9HBW9 690 aa27.63■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 KLHL9Q9P2J3 617 aa27.63■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa27.62■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 GPR171O14626 319 aa27.62■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 CLRN1P58418 232 aa27.62■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 NEDD8Q15843 81 aa27.62■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 OR4F15Q8NGB8 312 aa27.62■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 OR6K6Q8NGW6 343 aa27.62■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 FAR1Q8WVX9 515 aa27.62■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 ROBO4Q8WZ75 1007 aa27.62■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 TSSK2Q96PF2 358 aa27.62■■■□□ 2.01
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