RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	PFN4	Q8NHR9	129 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	PIGX	Q8TBF5	258 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	ABHD3	Q8WU67	409 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	SLCO4A1	Q96BD0	722 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	MOGAT1	Q96PD6	335 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	GP6	Q9HCN6	339 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	TRBV4-1	A0A0J9YWV2	114 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	HTR3E	A5X5Y0	456 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	ZNF716	A6NP11	495 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	LRRN3	E7EW58	273 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222		M0R082	166 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	ABCD4	O14678	606 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	PIP5K1C	O60331	668 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	KRT36	O76013	467 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	GADD45G	O95257	159 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	CH25H	O95992	272 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	ADA	P00813	363 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	NQO1	P15559	274 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	SLC25A16	P16260	332 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	GRPR	P30550	384 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	AGTR1	P30556	359 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	RRM2	P31350	389 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	HMGA2	P52926	109 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	SLC16A1	P53985	500 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	SPIB	Q01892	262 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	SLC17A1	Q14916	467 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	FGD3	Q5JSP0	725 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	OTUD3	Q5T2D3	398 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	TBPL2	Q6SJ96	375 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	ZNF730	Q6ZMV8	503 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	BEND4	Q6ZU67	534 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	MBOAT2	Q6ZWT7	520 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	C10orf53	Q8N6V4	93 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	RAB3IP	Q96QF0	476 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	PSD2	Q9BQI7	771 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	FKRP	Q9H9S5	495 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	BCO1	Q9HAY6	547 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	C20orf141	Q9NUB4	165 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	SEC14L4	Q9UDX3	406 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	RRP15	Q9Y3B9	282 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	LRP5L	A4QPB2	252 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	FKBP6	O75344	327 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	VAMP5	O95183	116 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	YES1	P07947	543 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	CBL	P22681	906 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	IL32	P24001	234 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	GTF2E2	P29084	291 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	IL2RG	P31785	369 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	LIMS1	P48059	325 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	ACTR3	P61158	418 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	PRKCD	Q05655	676 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	P2RY6	Q15077	328 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	RAB35	Q15286	201 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	SEC23B	Q15437	767 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	STK11	Q15831	433 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	OR2T5	Q6IEZ7	315 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	H1FNT	Q75WM6	255 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	NRM	Q8IXM6	262 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	C3orf56	Q8N813	242 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	SCAI	Q8N9R8	606 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	STEAP2	Q8NFT2	490 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	OR2T29	Q8NH02	315 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	OR52J3	Q8NH60	311 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	LIPH	Q8WWY8	451 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	BPIFA2	Q96DR5	249 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	SGTB	Q96EQ0	304 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	ASPN	Q9BXN1	380 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	NANS	Q9NR45	359 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	ZNF229	Q9UJW7	825 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	RASD1	Q9Y272	281 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222		A0A1W2PR80	420 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	SH3PXD2B	A1X283	911 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	ZNF724	A8MTY0	619 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	VWC2L	B2RUY7	222 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	LYZL6	O75951	148 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	OR7A10	O76100	309 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	CST1	P01037	141 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	ASAH2B	P0C7U1	165 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	TTK	P33981	857 aa		12.05	□□□□□ -0.48

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