RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 FADS6Q8N9I5 356 aa7.56□□□□□ -1.2
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CS-215ENST00000549143 HSD17B8Q92506 261 aa7.56□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 GHSRQ92847 366 aa7.56□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 PELI1Q96FA3 418 aa7.56□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 DACH2Q96NX9 599 aa7.56□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 CHST11Q9NPF2 352 aa7.56□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 LAMP5Q9UJQ1 280 aa7.56□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa7.56□□□□□ -1.2
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CS-215ENST00000549143 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
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CS-215ENST00000549143 BARHL1Q9BZE3 327 aa7.56□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 SACM1LQ9NTJ5 587 aa7.56□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 KCNG2Q9UJ96 466 aa7.56□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
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CS-215ENST00000549143 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
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CS-215ENST00000549143 NKX2-8O15522 239 aa7.55□□□□□ -1.2
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CS-215ENST00000549143 BMP4P12644 408 aa7.55□□□□□ -1.2
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CS-215ENST00000549143 MAGEB1P43366 347 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 LIMK1P53667 647 aa7.55□□□□□ -1.2
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CS-215ENST00000549143 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
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CS-215ENST00000549143 ZNF227Q86WZ6 799 aa7.55□□□□□ -1.2
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CS-215ENST00000549143 SVILO95425 2214 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 ZNF407Q9C0G0 2248 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 PINLYPA6NC86 204 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 METTL15A6NJ78 407 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 TNFSF11O14788 317 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 LRP3O75074 770 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 SNX4O95219 450 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 WDPCPO95876 746 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 ZNF43P17038 809 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 ENPP1P22413 925 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 GDF1P27539 372 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 UGT2B10P36537 528 aa7.55□□□□□ -1.2
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CS-215ENST00000549143 SIRPAP78324 504 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 SELENBP1Q13228 472 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 TMED1Q13445 227 aa7.55□□□□□ -1.2
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CS-215ENST00000549143 SYT9Q86SS6 491 aa7.55□□□□□ -1.2
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CS-215ENST00000549143 ZNF519Q8TB69 540 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 FRMD6Q96NE9 622 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 UCN2Q96RP3 112 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 INTS14Q96SY0 518 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 AMELYQ99218 206 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 POTEKPQ9BYX7 375 aa7.55□□□□□ -1.2
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CS-215ENST00000549143 SEC61A2Q9H9S3 476 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 PLGRKTQ9HBL7 147 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 HMG20AQ9NP66 347 aa7.55□□□□□ -1.2
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