RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 AHCYP23526 432 aa18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 APEX1P27695 318 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 OTX2P32243 289 aa18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 PSMB10P40306 273 aa18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 EXT1Q16394 746 aa18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF684Q5T5D7 378 aa18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 OR5M10Q6IEU7 315 aa18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 SYT4Q9H2B2 425 aa18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 C2orf72A6NCS6 295 aa18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 DXOO77932 396 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 RAB3BP20337 219 aa18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 OR10A3P58181 314 aa18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 RIN1Q13671 783 aa18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 BICRALQ6AI39 1079 aa18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM220AQ7Z4H9 259 aa18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 Q8N402 240 aa18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 ESX1Q8N693 406 aa18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 PHYHIPQ92561 330 aa18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 HPS1Q92902 700 aa18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 TXNDC15Q96J42 360 aa18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 MNTQ99583 582 aa18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC22A4Q9H015 551 aa18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 MALT1Q9UDY8 824 aa18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 RASD1Q9Y272 281 aa18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 CEP250Q9BV73 2442 aa18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 RFX2P48378 723 aa18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 TMED10P49755 219 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 RPL27P61353 136 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 MADCAM1Q13477 382 aa18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 SSPNQ14714 243 aa18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 CDC20BQ86Y33 519 aa18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 HRH3Q9Y5N1 445 aa18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 A0A0G2JK05 382 aa18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 UCHL1P09936 223 aa18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 FBXO45P0C2W1 286 aa18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 ELK1P19419 428 aa18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 THBS2P35442 1172 aa18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 CD300CQ08708 224 aa18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 Q0VFX4 171 aa18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 TRIQKQ629K1 86 aa18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 PM20D2Q8IYS1 436 aa18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 OR10G3Q8NGC4 313 aa18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 RPS4Y2Q8TD47 263 aa18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 KLHL15Q96M94 604 aa18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 SNX18Q96RF0 628 aa18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 OR11A1Q9GZK7 315 aa18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 GALNT9Q9HCQ5 603 aa18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 LAMP5Q9UJQ1 280 aa18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 PSMD9O00233 223 aa18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 PLPP3O14495 311 aa18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 TM4SF5O14894 197 aa18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 RAD1O60671 282 aa18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 ITGA10O75578 1167 aa18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 DLSTP36957 453 aa18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 TALDO1P37837 337 aa18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 PTGDSP41222 190 aa18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 RPS15P62841 145 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 P2RY14Q15391 338 aa18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 ACKR1Q16570 336 aa18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 SPATC1Q76KD6 591 aa18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 TRILQ7L0X0 811 aa18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 C19orf18Q8NEA5 215 aa18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 IL17RDQ8NFM7 739 aa18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 OR6S1Q8NH40 331 aa18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 TXNIPQ9H3M7 391 aa18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 WDR76Q9H967 626 aa18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 CYSLTR2Q9NS75 346 aa18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF281Q9Y2X9 895 aa18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 A0A1W2PPK0 400 aa18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 PRSS37A4D1T9 235 aa18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 TVP23AA6NH52 213 aa18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 PRR32B1ATL7 298 aa18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF879B4DU55 563 aa18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 PLGP00747 810 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 KRT8P05787 483 aa18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 NTRK2Q16620 822 aa18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 ASCL5Q7RTU5 278 aa18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC22A8Q8TCC7 542 aa18.23■□□□□ 0.51
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