RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520837.5

TSPAN18-208, Transcript of tetraspanin 18, humanhuman

TSL 4

Gene TSPAN18, Length 565 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18-208ENST00000520837 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 CREBBPQ92793 2442 aa8.31□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa8.31□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 DCHS2Q6V1P9 2916 aa8.3□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 LRBAP50851 2863 aa8.3□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 A0A1W2PRG6 482 aa8.3□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 IRGMA1A4Y4 181 aa8.3□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 OR2M5A3KFT3 312 aa8.3□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 CLCA1A8K7I4 914 aa8.3□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 PRSS44E7EML9 344 aa8.3□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 E9PLN8 166 aa8.3□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 C11orf98E9PRG8 122 aa8.3□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 M0R082 166 aa8.3□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 SULT2B1O00204 365 aa8.3□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 BHLHE40O14503 412 aa8.3□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 XKRYO14609 159 aa8.3□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 ZIC3O60481 467 aa8.3□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 NPIPB7O75200 414 aa8.3□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 CLDN1O95832 211 aa8.3□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 CD14P08571 375 aa8.3□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 SMIM18P0DKX4 95 aa8.3□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 IL11P20809 199 aa8.3□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 RPL5P46777 297 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 SLC16A1P53985 500 aa8.3□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 RPS7P62081 194 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 SLC35A1P78382 337 aa8.3□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 ADORA2A-AS1P86434 159 aa8.3□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 LTBQ06643 244 aa8.3□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 LGALS3BPQ08380 585 aa8.3□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 MYBPHQ13203 477 aa8.3□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 C1DQ13901 141 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 SGCBQ16585 318 aa8.3□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 KLHL12Q53G59 568 aa8.3□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 KLHL22Q53GT1 634 aa8.3□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 EMC4Q5J8M3 183 aa8.3□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 SLC25A30Q5SVS4 291 aa8.3□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 GPR139Q6DWJ6 353 aa8.3□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 PLBD1Q6P4A8 553 aa8.3□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 MZT2AQ6P582 158 aa8.3□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 CPOQ8IVL8 374 aa8.3□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 GID4Q8IVV7 300 aa8.3□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 CCDC103Q8IW40 242 aa8.3□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 RPRMLQ8N4K4 120 aa8.3□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 SVOPQ8N4V2 548 aa8.3□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 OR52E2Q8NGJ4 325 aa8.3□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 OR4K13Q8NH42 304 aa8.3□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 NEIL3Q8TAT5 605 aa8.3□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 ZNF417Q8TAU3 575 aa8.3□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 POC1BQ8TC44 478 aa8.3□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 APH1BQ8WW43 257 aa8.3□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa8.3□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 VKORC1Q9BQB6 163 aa8.3□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 KATNB1Q9BVA0 655 aa8.3□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 INIPQ9NRY2 104 aa8.3□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 QPCTLQ9NXS2 382 aa8.3□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa8.3□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP8.3□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 HIF3AQ9Y2N7 669 aa8.3□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa8.3□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 MYO9AB2RTY4 2548 aa8.3□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 MPDZO75970 2070 aa8.3□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 OR14I1A6ND48 311 aa8.29□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 WIPF3A6NGB9 483 aa8.29□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 LIPT2A6NK58 231 aa8.29□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 SLC22A31A6NKX4 558 aa8.29□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 B4DXG7 233 aa8.29□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 MCIDASD6RGH6 385 aa8.29□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 PLPP3O14495 311 aa8.29□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 PRODHO43272 600 aa8.29□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 SLC2A10O95528 541 aa8.29□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 RENP00797 406 aa8.29□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 F13BP05160 661 aa8.29□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 HPNP05981 417 aa8.29□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 ASAH2BP0C7U1 165 aa8.29□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 GABRB1P18505 474 aa8.29□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 UQCRC1P31930 480 aa8.29□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 CDH11P55287 796 aa8.29□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 FXYD6P3P58550 94 aa8.29□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 RELBQ01201 579 aa8.29□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 SRYQ05066 204 aa8.29□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 PIGFQ07326 219 aa8.29□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP8.29□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 PMPCAQ10713 525 aa8.29□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 ST3GAL4Q11206 333 aa8.29□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 ITGADQ13349 1161 aa8.29□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 NEDD8Q15843 81 aa8.29□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 TMEM201Q5SNT2 666 aa8.29□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 PDSS1Q5T2R2 415 aa8.29□□□□□ -1.08
TSPAN18-208ENST00000520837 TMEM211Q6ICI0 200 aa8.29□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms