RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498517.5

ARHGEF3-215, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 5

Gene ARHGEF3, Length 787 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-215ENST00000498517 FAM25GB3EWG6 89 aa5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 B4DXG7 233 aa5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 J3QRE1 110 aa5.05□□□□□ -1.6
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ARHGEF3-215ENST00000498517 CDC42EP2O14613 210 aa5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 TFECO14948 347 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 PLA2G10O15496 165 aa5.05□□□□□ -1.6
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ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC2A10O95528 541 aa5.05□□□□□ -1.6
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ARHGEF3-215ENST00000498517 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
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ARHGEF3-215ENST00000498517 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP5.05□□□□□ -1.6
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ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF614Q8N883 585 aa5.05□□□□□ -1.6
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ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF160Q9HCG1 818 aa5.05□□□□□ -1.6
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ARHGEF3-215ENST00000498517 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa5.05□□□□□ -1.6
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ARHGEF3-215ENST00000498517 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa5.05□□□□□ -1.6
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ARHGEF3-215ENST00000498517 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
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ARHGEF3-215ENST00000498517 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa5.04□□□□□ -1.6
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ARHGEF3-215ENST00000498517 CDHR4A6H8M9 788 aa5.04□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 FAM183AA6NL82 134 aa5.04□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 A8MV72 311 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 NPIPA7E9PJI5 369 aa5.04□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 BHLHE40O14503 412 aa5.04□□□□□ -1.6
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