RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494037.1

TSPAN7-208, Transcript of tetraspanin 7, humanhuman

TSL 4

Gene TSPAN7, Length 575 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN7-208ENST00000494037 RIMS3Q9UJD0 308 aa7.18□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 A4GNTQ9UNA3 340 aa7.18□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 POFUT2Q9Y2G5 429 aa7.18□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa7.17□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 J3KTA2 159 aa7.17□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 PDE5AO76074 875 aa7.17□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 IFNA14P01570 189 aa7.17□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 F13BP05160 661 aa7.17□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 OR4A8P0C604 315 aa7.17□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 PATE4P0C8F1 98 aa7.17□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 PGA4P0DJD7 388 aa7.17□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 PGA3P0DJD8 388 aa7.17□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 PAX7P23759 505 aa7.17□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 THBS4P35443 961 aa7.17□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 ARR3P36575 388 aa7.17□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 SERPINF1P36955 418 aa7.17□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 AQP2P41181 271 aa7.17□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 RBM34P42696 430 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 YAP1P46937 504 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 GSK3BP49841 420 aa7.17□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 NUDT2P50583 147 aa7.17□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 EFNA4P52798 201 aa7.17□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 SEC24CP53992 1094 aa7.17□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 LIPEQ05469 1076 aa7.17□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 CHRNB3Q05901 458 aa7.17□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 PIGFQ07326 219 aa7.17□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 RAB35Q15286 201 aa7.17□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 EFNB3Q15768 340 aa7.17□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 MSMPQ1L6U9 139 aa7.17□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 GSG1Q2KHT4 349 aa7.17□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 KRT80Q6KB66 452 aa7.17□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 CLEC2AQ6UVW9 174 aa7.17□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 SPATA21Q7Z572 469 aa7.17□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 ARPINQ7Z6K5 226 aa7.17□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 PRIMA1Q86XR5 153 aa7.17□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 ANKS4BQ8N8V4 417 aa7.17□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 NOXO1Q8NFA2 376 aa7.17□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 NUP37Q8NFH4 326 aa7.17□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 OR4F15Q8NGB8 312 aa7.17□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 MOSPD2Q8NHP6 518 aa7.17□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 FGFBP3Q8TAT2 258 aa7.17□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 ASB10Q8WXI3 467 aa7.17□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 ZNF566Q969W8 418 aa7.17□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 SGTBQ96EQ0 304 aa7.17□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 PRRC1Q96M27 445 aa7.17□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 ZNF347Q96SE7 839 aa7.17□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 RHNO1Q9BSD3 238 aa7.17□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 MYLK2Q9H1R3 596 aa7.17□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa7.17□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 SNX13Q9Y5W8 968 aa7.17□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa7.16□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 B9A039 149 aa7.16□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 MCIDASD6RGH6 385 aa7.16□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 hCG_2039718K7EN88 272 aa7.16□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 CXCR6O00574 342 aa7.16□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 FFAR1O14842 300 aa7.16□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 DHHO43323 396 aa7.16□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 CD5LO43866 347 aa7.16□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 GPRIN2O60269 458 aa7.16□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 CCDC22O60826 627 aa7.16□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 ZNF682O95780 498 aa7.16□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 BCL10O95999 233 aa7.16□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 IGF2P01344 180 aa7.16□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 IGHG1P01857 330 aa7.16□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 HIST1H2ABP04908 130 aa7.16□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 TSPAN19P0C672 248 aa7.16□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 THRBP10828 461 aa7.16□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 BMP4P12644 408 aa7.16□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 GIPRP48546 466 aa7.16□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 SELENOWP63302 87 aa7.16□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 MYBPC1Q00872 1141 aa7.16□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 LRFN4Q6PJG9 635 aa7.16□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 HACD2Q6Y1H2 254 aa7.16□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa7.16□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 ZNF584Q8IVC4 421 aa7.16□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 SKA3Q8IX90 412 aa7.16□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 CCDC36Q8IYA8 594 aa7.16□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 CDK20Q8IZL9 346 aa7.16□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 OFCC1Q8IZS5 231 aa7.16□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 SVOPLQ8N434 492 aa7.16□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 C10orf105Q8TEF2 133 aa7.16□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 FAM168AQ92567 244 aa7.16□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 HIST1H2ACQ93077 130 aa7.16□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 HSH2DQ96JZ2 352 aa7.16□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 SEPHS2Q99611 448 aa7.16□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 SH3GL3Q99963 347 aa7.16□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 FAM107BQ9H098 131 aa7.16□□□□□ -1.26
TSPAN7-208ENST00000494037 PLK3Q9H4B4 646 aa7.16□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.5 ms