RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482558.5

SNX13-208, Transcript of sorting nexin 13, humanhuman

TSL 2

Gene SNX13, Length 1,139 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13-208ENST00000482558 FOXS1O43638 330 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 SLC19A2O60779 497 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 CDRT1O95170 752 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 NDUFB2O95178 105 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 FSHBP01225 129 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 APEHP13798 732 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 ZNF20P17024 532 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 ZNF28P17035 718 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 HTR2AP28223 471 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 TNFSF8P32971 234 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 PTGER1P34995 402 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 RORAP35398 523 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 THBS4P35443 961 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 PPICP45877 212 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 SLC6A8P48029 635 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 GABRA4P48169 554 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 NXPH1P58417 271 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 ACTA2P62736 377 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 ACTG2P63267 376 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 HSD11B2P80365 405 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 ID2Q02363 134 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 HSF2Q03933 536 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 KRTAP1-1Q07627 177 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 TCF15Q12870 199 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 C1orf61Q13536 156 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 CBFBQ13951 182 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 LRIT3Q3SXY7 679 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 IGSF11Q5DX21 431 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 ALG10BQ5I7T1 473 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 SLC35D3Q5M8T2 416 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 PRR31Q5SQ13 230 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 PDZK1Q5T2W1 519 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 CCNJQ5T5M9 372 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 SHEQ5VZ18 495 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 NIPAL3Q6P499 406 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 KCTD9Q7L273 389 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 OLIG3Q7RTU3 272 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 PRSS41Q7RTY9 318 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 OAFQ86UD1 273 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 SLC22A16Q86VW1 577 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 TPRA1Q86W33 373 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 SPEM1Q8N4L4 309 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 MS4A15Q8N5U1 240 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 NHLRC2Q8NBF2 726 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 ZNF485Q8NCK3 441 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 OR5T3Q8NGG3 340 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 ST7LQ8TDW4 575 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 LIPHQ8WWY8 451 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 PHYHIPQ92561 330 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 SGTBQ96EQ0 304 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 NDC1Q9BTX1 674 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 IFT27Q9BW83 186 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 FAM60AQ9NP50 221 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 ABCB10Q9NRK6 738 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 UBQLN4Q9NRR5 601 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 SOHLH2Q9NX45 425 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 TAS2R16Q9NYV7 291 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 SEMA5BQ9P283 1151 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 SLC23A1Q9UHI7 598 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 ICAM5Q9UMF0 924 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 ZNF337Q9Y3M9 751 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 A0A087WUJ7 227 aa6.98□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 A0A1W2PPC1 479 aa6.98□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 DAPL1A0PJW8 107 aa6.98□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 SMIM30A4D0T7 59 aa6.98□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 ANKRD61A6NGH8 418 aa6.98□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 CDC42EP2O14613 210 aa6.98□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 ARPC3O15145 178 aa6.98□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 RGS5O15539 181 aa6.98□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 SEC14L5O43304 696 aa6.98□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 NARSO43776 548 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 DUX1O43812 170 aa6.98□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 CSTAP01040 98 aa6.98□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 IFNA16P05015 189 aa6.98□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 NGFRP08138 427 aa6.98□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 CT62P0C5K7 136 aa6.98□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 HPGDP15428 266 aa6.98□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 TBXA2RP21731 343 aa6.98□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 CENPAP49450 140 aa6.98□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 DIO1P49895 249 aa6.98□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 CAMPP49913 170 aa6.98□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 PTTG1IPP53801 180 aa6.98□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 TIRAPP58753 221 aa6.98□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 HOXC5Q00444 222 aa6.98□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 ZNF542PQ5EBM4 170 aa6.98□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 HACD4Q5VWC8 232 aa6.98□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 WBP2NLQ6ICG8 309 aa6.98□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 Q6ZS52 159 aa6.98□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 GPR135Q8IZ08 494 aa6.98□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 SYS1Q8N2H4 156 aa6.98□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 C17orf47Q8NEP4 570 aa6.98□□□□□ -1.29
SNX13-208ENST00000482558 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms