RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 TIPRLO75663 272 aa10.2□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 KRT33AO76009 404 aa10.2□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 BAG2O95816 211 aa10.2□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 RAP2AP10114 183 aa10.2□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 APEHP13798 732 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 PCMT1P22061 227 aa10.2□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 IGFBP5P24593 272 aa10.2□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 GRPRP30550 384 aa10.2□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 OR1E2P47887 323 aa10.2□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 SLC16A1P53985 500 aa10.2□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 TAS2R41P59536 307 aa10.2□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 H3F3AP84243 136 aa10.2□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 EGR4Q05215 589 aa10.2□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 C1DQ13901 141 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 GGTLC2Q14390 218 aa10.2□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 SLC17A1Q14916 467 aa10.2□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 FAM69AQ5T7M9 428 aa10.2□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 KLHL24Q6TFL4 600 aa10.2□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 UGT2A3Q6UWM9 527 aa10.2□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 AAED1Q7RTV5 226 aa10.2□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 KDM8Q8N371 416 aa10.2□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 OR4D11Q8NGI4 311 aa10.2□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 OR52N5Q8NH56 324 aa10.2□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 MFSD8Q8NHS3 518 aa10.2□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 TAAR8Q969N4 342 aa10.2□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 EPYCQ99645 322 aa10.2□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 PTDSS2Q9BVG9 487 aa10.2□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 C12orf10Q9HB07 376 aa10.2□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 PARPBPQ9NWS1 579 aa10.2□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 SEC14L4Q9UDX3 406 aa10.2□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 MALT1Q9UDY8 824 aa10.2□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 PRDM4Q9UKN5 801 aa10.2□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 SLC7A7Q9UM01 511 aa10.2□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 AP4S1Q9Y587 144 aa10.2□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 SLC25A15Q9Y619 301 aa10.2□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 ATP23Q9Y6H3 246 aa10.2□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 A0A087WUJ7 227 aa10.19□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa10.19□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 TRAPPC13A5PLN9 417 aa10.19□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 M0R082 166 aa10.19□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 CHP2O43745 196 aa10.19□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 OR2T1O43869 369 aa10.19□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 MGRN1O60291 552 aa10.19□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 FMO6PO60774 539 aa10.19□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 NPIPB7O75200 414 aa10.19□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 SERPINI2O75830 405 aa10.19□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 ATP6V1G2O95670 118 aa10.19□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 WNT11O96014 354 aa10.19□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 SEMG1P04279 462 aa10.19□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 FABP3P05413 133 aa10.19□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 SCGB2A2Q13296 93 aa10.19□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 IQCCQ4KMZ1 466 aa10.19□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 NIPAL3Q6P499 406 aa10.19□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 ZNF613Q6PF04 617 aa10.19□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 C5orf46Q6UWT4 87 aa10.19□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa10.19□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 ZNF417Q8TAU3 575 aa10.19□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa10.19□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 KCNS3Q9BQ31 491 aa10.19□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 CHID1Q9BWS9 393 aa10.19□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 ASPNQ9BXN1 380 aa10.19□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 RASD1Q9Y272 281 aa10.19□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa10.18□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 A0A1W2PR80 420 aa10.18□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 FTCDNL1E5RQL4 147 aa10.18□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 LRRN3E7EW58 273 aa10.18□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 DIRAS1O95057 198 aa10.18□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 VAMP5O95183 116 aa10.18□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 IFNW1P05000 195 aa10.18□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 ANPEPP15144 967 aa10.18□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 ZNF43P17038 809 aa10.18□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 NTF4P34130 210 aa10.18□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 NR4A2P43354 598 aa10.18□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 YAP1P46937 504 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 RIPK1Q13546 671 aa10.18□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 TSPO2Q5TGU0 170 aa10.18□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 SLC41A3Q96GZ6 507 aa10.18□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 MUS81Q96NY9 551 aa10.18□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 DCLRE1BQ9H816 532 aa10.18□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 YY1AP1Q9H869 796 aa10.18□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa10.18□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 ARMC1Q9NVT9 282 aa10.18□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 VSTM5A8MXK1 200 aa10.17□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 VWC2LB2RUY7 222 aa10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.5 ms