RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415172.1

VPS13A-AS1-201, VPS13A antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS13A-AS1, Length 519 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ALPK1Q96QP1 1244 aa15.21■□□□□ 0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TMEM204Q9BSN7 226 aa15.21■□□□□ 0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FUZQ9BT04 418 aa15.21■□□□□ 0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TXNIPQ9H3M7 391 aa15.21■□□□□ 0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LIME1Q9H400 295 aa15.21■□□□□ 0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 UBTD1Q9HAC8 227 aa15.21■□□□□ 0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GLTPQ9NZD2 209 aa15.21■□□□□ 0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 POFUT2Q9Y2G5 429 aa15.21■□□□□ 0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCDC168Q8NDH2 2452 aa15.21■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DPRXA6NFQ7 191 aa15.2■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 AQP12BA6NM10 295 aa15.2■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CENPBD1B2RD01 187 aa15.2■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR10H3O60404 316 aa15.2■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RAF1P04049 648 aa15.2■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NR2C1P13056 603 aa15.2■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RPL4P36578 427 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OMPP47874 163 aa15.2■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LIMS1P48059 325 aa15.2■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CTXN1P60606 82 aa15.2■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KEAP1Q14145 624 aa15.2■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FLOT2Q14254 428 aa15.2■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZBED5Q49AG3 693 aa15.2■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 AQP12AQ8IXF9 295 aa15.2■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NOXO1Q8NFA2 376 aa15.2■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa15.2■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa15.2■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FREM1Q5H8C1 2179 aa15.19■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa15.19■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 M0R1B8 84 aa15.19■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TNFRSF11BO00300 401 aa15.19■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GSC2O15499 205 aa15.19■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SEC14L2O76054 403 aa15.19■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IGHMP01871 453 aa15.19■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RAP2AP10114 183 aa15.19■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ACADSP16219 412 aa15.19■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DNASE1P24855 282 aa15.19■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PTAFRP25105 342 aa15.19■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RPL27P61353 136 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FHL1Q13642 323 aa15.19■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ARMC4Q5T2S8 1044 aa15.19■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FAM205BPQ63HN1 556 aa15.19■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IGFN1Q86VF2 1251 aa15.19■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FOXB1Q99853 325 aa15.19■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa15.19■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NELFAQ9H3P2 528 aa15.19■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 POMPQ9Y244 141 aa15.19■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NF1P21359 2839 aa15.19■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DHRS12A0PJE2 317 aa15.18■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 UNC119BA6NIH7 251 aa15.18■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ABCD4O14678 606 aa15.18■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ENTPD5O75356 428 aa15.18■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TRMUO75648 421 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NDUFB2O95178 105 aa15.18■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PLAUP00749 431 aa15.18■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 QDPRP09417 244 aa15.18■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CD40P25942 277 aa15.18■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CAPZA2P47755 286 aa15.18■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RUNX1T1Q06455 604 aa15.18■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ADAM5Q6NVV9 412 aa15.18■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF813Q6ZN06 617 aa15.18■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C20orf204Q6ZNR8 217 aa15.18■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SPATA24Q86W54 205 aa15.18■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCDC36Q8IYA8 594 aa15.18■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ADGRG5Q8IZF4 528 aa15.18■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LRRC75AQ8NAA5 344 aa15.18■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SYT14Q8NB59 555 aa15.18■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RADILQ96JH8 1075 aa15.18■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KATNB1Q9BVA0 655 aa15.18■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 REEP1Q9H902 201 aa15.18■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MGAT4BQ9UQ53 548 aa15.18■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SIGLEC7Q9Y286 467 aa15.18■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa15.18■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 A6NIZ1 184 aa15.17■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HS3ST1O14792 307 aa15.17■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DHHO43323 396 aa15.17■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CD14P08571 375 aa15.17■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 B4GALT1P15291 398 aa15.17■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FPR3P25089 353 aa15.17■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ACVR1BP36896 505 aa15.17■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF84P51523 738 aa15.17■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HMGA2P52926 109 aa15.17■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RAP1BP61224 184 aa15.17■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RAP1AP62834 184 aa15.17■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TUBA1BP68363 451 aa15.17■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TUBA4AP68366 448 aa15.17■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CD47Q08722 323 aa15.17■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TESK1Q15569 626 aa15.17■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HIST3H3Q16695 136 aa15.17■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR2T5Q6IEZ7 315 aa15.17■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LRFN4Q6PJG9 635 aa15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.3 ms