RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412640.6

SOX9-AS1-201, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 635 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OR7A10O76100 309 aa8.48□□□□□ -1.05
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SOX9-AS1-201ENST00000412640 TSPAN19P0C672 248 aa8.48□□□□□ -1.05
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SOX9-AS1-201ENST00000412640 DUSP19Q8WTR2 217 aa8.47□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ST8SIA1Q92185 356 aa8.47□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RFKQ969G6 155 aa8.47□□□□□ -1.05
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SOX9-AS1-201ENST00000412640 YIPF6Q96EC8 236 aa8.47□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa8.47□□□□□ -1.05
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SOX9-AS1-201ENST00000412640 KLHDC3Q9BQ90 382 aa8.47□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 JAM3Q9BX67 310 aa8.47□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SHARPINQ9H0F6 387 aa8.47□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RACGAP1Q9H0H5 632 aa8.47□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CXorf56Q9H5V9 222 aa8.47□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 AMBNQ9NP70 447 aa8.47□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CMC2Q9NRP2 79 aa8.47□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa8.47□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OSGIN1Q9UJX0 560 aa8.47□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP8.47□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
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