RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409531.5

TSPAN4-208, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TSPAN4, Length 1,339 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-208ENST00000409531 ZIC4Q8N9L1 334 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN4-208ENST00000409531 ASB10Q8WXI3 467 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN4-208ENST00000409531 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TSPAN4-208ENST00000409531 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TSPAN4-208ENST00000409531 SLC38A2Q96QD8 506 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN4-208ENST00000409531 TSPAN32Q96QS1 320 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN4-208ENST00000409531 GRIP2Q9C0E4 1043 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN4-208ENST00000409531 KCNJ16Q9NPI9 418 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN4-208ENST00000409531 MED29Q9NX70 200 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN4-208ENST00000409531 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TSPAN4-208ENST00000409531 CLEC4AQ9UMR7 237 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN4-208ENST00000409531 MYO9AB2RTY4 2548 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 SLC35F4A4IF30 521 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 IFNGP01579 166 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 IGHG1P01857 330 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 NR2C1P13056 603 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 CTSSP25774 331 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 ACVR1BP36896 505 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 CDC42P60953 191 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 MELKQ14680 651 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 ARMC4Q5T2S8 1044 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 SLX4IPQ5VYV7 408 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 TTC23Q5W5X9 447 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 NIPAL3Q6P499 406 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 CASP12Q6UXS9 341 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 IZUMO2Q6UXV1 221 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 JAZF1Q86VZ6 243 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 OR6K3Q8NGY3 331 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 FNDC8Q8TC99 324 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 TXNDC15Q96J42 360 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 PLEKHA8Q96JA3 519 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 HRASLS5Q96KN8 279 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 Q96M85 177 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 MBOAT4Q96T53 435 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 SFXN3Q9BWM7 321 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 FAM118AQ9NWS6 357 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 KLHL21Q9UJP4 597 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 FREM1Q5H8C1 2179 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 RIIAD1A6NNX1 92 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 DLGAP1O14490 977 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 SLC16A6O15403 523 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 AHCYL1O43865 530 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 SLC43A1O75387 559 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 IL18BPO95998 194 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 ACADSP16219 412 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 EPHA2P29317 976 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 OPRM1P35372 400 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 AQP4P55087 323 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 ZNF787Q6DD87 383 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 LIX1LQ8IVB5 337 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 IQCF1Q8N6M8 205 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 OR4Q3Q8NH05 313 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 ZNF519Q8TB69 540 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 CYGBQ8WWM9 190 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 ZNF566Q969W8 418 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 LRR1Q96L50 414 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 OR2M2Q96R28 347 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 EMC6Q9BV81 110 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 CMC2Q9NRP2 79 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 GMPPBQ9Y5P6 360 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 CACNA1CQ13936 2221 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 H0YAE9 185 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 ARHGEF9O43307 516 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 ZNF432O94892 652 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 ZNF3P17036 446 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 CAPGP40121 348 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 CLRN1P58418 232 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 SIRPAP78324 504 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 ITGADQ13349 1161 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 CAMK2DQ13557 499 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 KEAP1Q14145 624 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 TMEM236Q5W0B7 351 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 C12orf73Q69YU5 71 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 ACSM5Q6NUN0 579 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 ZNF100Q8IYN0 542 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 POMGNT2Q8NAT1 580 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 APH1AQ96BI3 265 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 RASD2Q96D21 266 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 SNX18Q96RF0 628 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 PITX2Q99697 317 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 ALG12Q9BV10 488 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 ADI1Q9BV57 179 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 TVP23BQ9NYZ1 205 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 CENPEQ02224 2701 aa14.61□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 NOTCH2Q04721 2471 aa14.61□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 NKX2-6A6NCS4 301 aa14.61□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 FAM90A27PA6NNH2 459 aa14.61□□□□□ -0.07
TSPAN4-208ENST00000409531 E9PQ18 207 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.6 ms