RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000171887.8

TNS1-201, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 10,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-201ENST00000171887 CLSTN3Q9BQT9 956 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 NDFIP1Q9BT67 221 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 EMC9Q9Y3B6 208 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 GPRIN2O60269 458 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 PLK5Q496M5 336 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 C17orf107Q6ZR85 190 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 TECTBQ96PL2 329 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 RNF39Q9H2S5 420 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 OR52D1Q9H346 318 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 OR52A1Q9UKL2 312 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 CSAG2Q9Y5P2 127 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 ADAM5Q6NVV9 412 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 OR1J2Q8NGS2 313 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 OR5B3Q8NH48 314 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 TSLPQ969D9 159 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 LRRC30A6NM36 301 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 NXPH2O95156 264 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 DUSP1P28562 367 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 HTR5AP47898 357 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 OR10A3P58181 314 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 PDE7AQ13946 482 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 APH1BQ8WW43 257 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 ZNF566Q969W8 418 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 NOX4Q9NPH5 578 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 MED17Q9NVC6 651 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 PIGLQ9Y2B2 252 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 NKX6-3A6NJ46 265 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 M0QYG6 137 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 RGS11O94810 467 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 PGGT1BP53609 377 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 HES1Q14469 280 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 PDZD3Q86UT5 571 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 ACPTQ9BZG2 426 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 FAM183AA6NL82 134 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 EDN3P14138 238 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 RAB13P51153 203 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 REEP5Q00765 189 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 AQP9O43315 295 aa8.6□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 RFC3P40938 356 aa8.6□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 IQCJQ1A5X6 159 aa8.6□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 SLC22A24Q8N4F4 322 aa8.6□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 CLEC1AQ8NC01 280 aa8.6□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 SCML1Q9UN30 329 aa8.6□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 SPO11Q9Y5K1 396 aa8.6□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 MLF1P58340 268 aa8.6□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 RING1Q06587 406 aa8.6□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 RNF212Q495C1 297 aa8.6□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 IER5LQ5T953 404 aa8.6□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 STEAP1BQ6NZ63 245 aa8.6□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 Q6ZTK2 550 aa8.6□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 OSTM1Q86WC4 334 aa8.6□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 BLNKQ8WV28 456 aa8.6□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 TMEM106AQ96A25 262 aa8.6□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 CACNA1GO43497 2377 aa8.6□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 ACOD1A6NK06 481 aa8.6□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 IDUAP35475 653 aa8.6□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 GNB1P62873 340 aa8.6□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 CDC20BQ86Y33 519 aa8.6□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 KCNJ15Q99712 375 aa8.6□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 UCK1Q9HA47 277 aa8.6□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 CAMK2AQ9UQM7 478 aa8.6□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 FAM72CH0Y354 149 aa8.6□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 MPGP29372 298 aa8.6□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 TNFRSF17Q02223 184 aa8.6□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 FAM72AQ5TYM5 149 aa8.6□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 FAM72DQ6L9T8 149 aa8.6□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 Q6ZRG5 221 aa8.6□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 SLC35D2Q76EJ3 337 aa8.6□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 TMEM135Q86UB9 458 aa8.6□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 FAM72BQ86X60 149 aa8.6□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 MUCL1Q96DR8 90 aa8.6□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 ADOQ96SZ5 270 aa8.6□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 OR2M5A3KFT3 312 aa8.6□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 GDF1P27539 372 aa8.6□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 LBX2Q6XYB7 198 aa8.6□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 CLDN22Q8N7P3 220 aa8.6□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 OR5D18Q8NGL1 313 aa8.6□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 C12orf10Q9HB07 376 aa8.6□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 GLB1P16278 677 aa8.6□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 CLDN12P56749 244 aa8.6□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 HOXC5Q00444 222 aa8.6□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 DEFB110Q30KQ9 67 aa8.6□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa8.6□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 RAB6CQ9H0N0 254 aa8.6□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 RAB22AQ9UL26 194 aa8.6□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms