RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 A0A1B0GX12 115 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRF-216ENST00000617451 ITGA2P17301 1181 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRF-216ENST00000617451 EPGNQ6UW88 154 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRF-216ENST00000617451 RNF217Q8TC41 542 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRF-216ENST00000617451 MOGAT1Q96PD6 335 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRF-216ENST00000617451 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM27Q9HBJ8 222 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRF-216ENST00000617451 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRF-216ENST00000617451 GMEB1Q9Y692 573 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRF-216ENST00000617451 B4DSR2 109 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRF-216ENST00000617451 TPST2O60704 377 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRF-216ENST00000617451 B4GALT1P15291 398 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRF-216ENST00000617451 PCMT1P22061 227 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRF-216ENST00000617451 NCALDP61601 193 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRF-216ENST00000617451 PUDPQ08623 228 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRF-216ENST00000617451 PMS2P3Q13401 168 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRF-216ENST00000617451 CAMK2DQ13557 499 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRF-216ENST00000617451 OR1Q1Q15612 314 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRF-216ENST00000617451 FXNQ16595 210 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRF-216ENST00000617451 SNX32Q86XE0 403 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRF-216ENST00000617451 FUNDC1Q8IVP5 155 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRF-216ENST00000617451 SYT3Q9BQG1 590 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRF-216ENST00000617451 ULBP2Q9BZM5 246 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRF-216ENST00000617451 USH1CQ9Y6N9 552 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRF-216ENST00000617451 TENM1Q9UKZ4 2725 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF726A6NNF4 738 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRF-216ENST00000617451 PLPP3O14495 311 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRF-216ENST00000617451 HPXP02790 462 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRF-216ENST00000617451 PPIBP23284 216 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
PTPRF-216ENST00000617451 GIPRP48546 466 aa21.42■■□□□ 1.02
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PTPRF-216ENST00000617451 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRF-216ENST00000617451 RINLQ6ZS11 566 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRF-216ENST00000617451 PXKQ7Z7A4 578 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRF-216ENST00000617451 OR6N1Q8NGY5 312 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRF-216ENST00000617451 FOXB1Q99853 325 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRF-216ENST00000617451 WFDC6Q9BQY6 131 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM43Q9BTV4 400 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRF-216ENST00000617451 VAPAQ9P0L0 249 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRF-216ENST00000617451 PRORSD1PA6NEY8 169 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRF-216ENST00000617451 LRRN3E7EW58 273 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRF-216ENST00000617451 RAB36O95755 333 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRF-216ENST00000617451 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
PTPRF-216ENST00000617451 COL8A2P25067 703 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRF-216ENST00000617451 ALDH3B1P43353 468 aa21.41■■□□□ 1.02
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PTPRF-216ENST00000617451 STX1BP61266 288 aa21.41■■□□□ 1.02
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PTPRF-216ENST00000617451 LRP11Q86VZ4 500 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRF-216ENST00000617451 CARM1Q86X55 608 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRF-216ENST00000617451 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
PTPRF-216ENST00000617451 RACGAP1Q9H0H5 632 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM38AQ9H6F2 299 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRF-216ENST00000617451 METRNQ9UJH8 293 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRF-216ENST00000617451 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa21.4■■□□□ 1.02
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PTPRF-216ENST00000617451 AHCYP23526 432 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRF-216ENST00000617451 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
PTPRF-216ENST00000617451 SEC24CP53992 1094 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRF-216ENST00000617451 RPS23P62266 143 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
PTPRF-216ENST00000617451 GALK2Q01415 458 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRF-216ENST00000617451 SCARB2Q14108 478 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRF-216ENST00000617451 PAGE3Q5JUK9 113 aa21.4■■□□□ 1.02
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PTPRF-216ENST00000617451 REP15Q6BDI9 236 aa21.4■■□□□ 1.02
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PTPRF-216ENST00000617451 C10orf53Q8N6V4 93 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRF-216ENST00000617451 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
PTPRF-216ENST00000617451 CLDND2Q8NHS1 167 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRF-216ENST00000617451 RDH5Q92781 318 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRF-216ENST00000617451 SPDL1Q96EA4 605 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF607Q96SK3 696 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRF-216ENST00000617451 IKZF5Q9H5V7 419 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRF-216ENST00000617451 SLC52A3Q9NQ40 469 aa21.4■■□□□ 1.02
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PTPRF-216ENST00000617451 SERPINB7O75635 380 aa21.39■■□□□ 1.01
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PTPRF-216ENST00000617451 SLC6A2P23975 617 aa21.39■■□□□ 1.01
PTPRF-216ENST00000617451 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
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PTPRF-216ENST00000617451 EVA1AQ9H8M9 152 aa21.39■■□□□ 1.01
PTPRF-216ENST00000617451 TCF7L2Q9NQB0 619 aa21.39■■□□□ 1.01
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC167Q9P0B6 97 aa21.39■■□□□ 1.01
PTPRF-216ENST00000617451 SLC13A4Q9UKG4 626 aa21.39■■□□□ 1.01
PTPRF-216ENST00000617451 FZR1Q9UM11 496 aa21.39■■□□□ 1.01
PTPRF-216ENST00000617451 SERPINI2O75830 405 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRF-216ENST00000617451 MT-ATP6P00846 226 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRF-216ENST00000617451 SAGP10523 405 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
PTPRF-216ENST00000617451 AQP1P29972 269 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRF-216ENST00000617451 CSNK1A1P48729 337 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM33P57088 247 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRF-216ENST00000617451 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
PTPRF-216ENST00000617451 RAB39AQ14964 217 aa21.38■■□□□ 1.01
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