RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 EDNRAP25101 427 aa10.23□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 DUSP7Q16829 419 aa10.23□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 FBXW9Q5XUX1 488 aa10.23□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 C11orf71Q6IPW1 123 aa10.23□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 FKBP9P1Q75LS8 142 aa10.23□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 VTCN1Q7Z7D3 282 aa10.23□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 ADGRG5Q8IZF4 528 aa10.23□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 C10orf53Q8N6V4 93 aa10.23□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 ZNF525Q8N782 197 aa10.23□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 TMEM99Q8N816 258 aa10.23□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 ZNF540Q8NDQ6 660 aa10.23□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 GPR32P1Q8NGA4 272 aa10.23□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 C10orf105Q8TEF2 133 aa10.23□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 CANT1Q8WVQ1 401 aa10.23□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 LZICQ8WZA0 190 aa10.23□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 APH1AQ96BI3 265 aa10.23□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 SLC47A1Q96FL8 570 aa10.23□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 WFDC6Q9BQY6 131 aa10.23□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 TAS2R16Q9NYV7 291 aa10.23□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 ZNF716A6NP11 495 aa10.22□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 TMEM229AB2RXF0 380 aa10.22□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 FKBP6O75344 327 aa10.22□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 MT-ND1P03886 318 aa10.22□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 IGHV4-31P0DP07 118 aa10.22□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 PNMTP11086 282 aa10.22□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 UMPSP11172 480 aa10.22□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 TNFRSF1BP20333 461 aa10.22□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 CD247P20963 164 aa10.22□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 IGHV1-2P23083 117 aa10.22□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 CD40P25942 277 aa10.22□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 PDLIM4P50479 330 aa10.22□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 CDH12P55289 794 aa10.22□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 SELENOWP63302 87 aa10.22□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 TGFBR3Q03167 851 aa10.22□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 PDK3Q15120 406 aa10.22□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 IFI44LQ53G44 452 aa10.22□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 TMEM225Q6GV28 225 aa10.22□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 ULK3Q6PHR2 472 aa10.22□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 PAQR6Q6TCH4 344 aa10.22□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 DEF8Q6ZN54 512 aa10.22□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 C10orf67Q8IYJ2 551 aa10.22□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 LSMEM1Q8N8F7 131 aa10.22□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 OR6T1Q8NGN1 323 aa10.22□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 STK35Q8TDR2 534 aa10.22□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 RASSF5Q8WWW0 418 aa10.22□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 SLC38A4Q969I6 547 aa10.22□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 SLCO4A1Q96BD0 722 aa10.22□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 PYURFQ96I23 114 aa10.22□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 ARHGDIGQ99819 225 aa10.22□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 S100A14Q9HCY8 104 aa10.22□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 ASB6Q9NWX5 421 aa10.22□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa10.22□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 SH3GLB1Q9Y371 365 aa10.22□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 ALPK2Q86TB3 2170 aa10.22□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa10.21□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 A0A0B4J2E0 115 aa10.21□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa10.21□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 A0A1B0GX12 115 aa10.21□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 AQP7P3A6NL99 342 aa10.21□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 E7EQL1 145 aa10.21□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 RAD51DO75771 328 aa10.21□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 LGI1O95970 557 aa10.21□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 PAX7P23759 505 aa10.21□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 ZNF83P51522 516 aa10.21□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 RCN1Q15293 331 aa10.21□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 NPTX1Q15818 432 aa10.21□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 ENTPD8Q5MY95 495 aa10.21□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 FAM120AOSQ5T036 256 aa10.21□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 C9orf135Q5VTT2 229 aa10.21□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 ZFP1Q6P2D0 407 aa10.21□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 CARM1Q86X55 608 aa10.21□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 C17orf78Q8N4C9 275 aa10.21□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 RFLNBQ8N5W9 214 aa10.21□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 OR9K2Q8NGE7 335 aa10.21□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 MAGIXQ9H6Y5 334 aa10.21□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 EVA1AQ9H8M9 152 aa10.21□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 CHODLQ9H9P2 273 aa10.21□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 NPAP1Q9NZP6 1156 aa10.21□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 UPB1Q9UBR1 384 aa10.21□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 BAG5Q9UL15 447 aa10.21□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 AMDHD2Q9Y303 409 aa10.21□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa10.21□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa10.2□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa10.2□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 H3BNX3 289 aa10.2□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 hCG_2039718K7EN88 272 aa10.2□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 M0R1B8 84 aa10.2□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 TCF21O43680 179 aa10.2□□□□□ -0.78
PRAME-210ENST00000442481 TPST2O60704 377 aa10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms