RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365426.1

RNU6-1335P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1335, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1335P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PTPRUQ92729 1446 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 A0A1B0GW55 424 aa0.59□□□□□ -2.31
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RNU6-1335P-201ENST00000365426 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SMCO2A6NFE2 343 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SRRM5B3KS81 715 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 E9PBE3 544 aa0.59□□□□□ -2.31
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RNU6-1335P-201ENST00000365426 PPP1R2P9O14990 202 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 KMOO15229 486 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RTL8CO15255 209 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RGS5O15539 181 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ZSCAN12O43309 604 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 MBTPS2O43462 519 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CHST1O43916 411 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TSC22D2O75157 780 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 NPIPB7O75200 414 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SUPT3HO75486 399 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 EEDO75530 441 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
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RNU6-1335P-201ENST00000365426 VENTXO95231 258 aa0.59□□□□□ -2.31
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RNU6-1335P-201ENST00000365426 LCA5LO95447 670 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 DIRAS3O95661 229 aa0.59□□□□□ -2.31
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RNU6-1335P-201ENST00000365426 MBD3O95983 291 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PAHP00439 452 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 F10P00742 488 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TIMP1P01033 207 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PTHP01270 115 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 IFNB1P01574 187 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 IGHDP01880 384 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 KRT14P02533 472 aa0.59□□□□□ -2.31
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RNU6-1335P-201ENST00000365426 DUX4L5P0CJ88 424 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 DUX4L6P0CJ89 424 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 DUX4L7P0CJ90 424 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RBMY1CP0DJD4 496 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 IGHV1-8P0DP01 117 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ERGP11308 486 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PGAM1P18669 254 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RAB3AP20336 220 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CNR1P21554 472 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 OMGP23515 440 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CCNE1P24864 410 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CXCR2P25025 360 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PSMB5P28074 263 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 AQP1P29972 269 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SERPINB5P36952 375 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 FDFT1P37268 417 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CXCL5P42830 114 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 MAGEA1P43355 309 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 BDKRB1P46663 353 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 HCAR3P49019 387 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CAMLGP49069 296 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CCT3P49368 545 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RGS4P49798 205 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SSR4P51571 173 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CDH6P55285 790 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 BIDP55957 195 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 STARD6P59095 220 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 KCNJ2P63252 427 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CCNA1P78396 465 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 NDPQ00604 133 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 IL1RL1Q01638 556 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TGFBR3Q03167 851 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CDH17Q12864 832 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SLAQ13239 276 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PLD1Q13393 1074 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 BTN1A1Q13410 526 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CUL2Q13617 745 aa0.59□□□□□ -2.31
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