RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309641.10

PDE4D-201, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,025 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-201ENST00000309641 SOX14O95416 240 aa8.01□□□□□ -1.13
PDE4D-201ENST00000309641 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
PDE4D-201ENST00000309641 FPR3P25089 353 aa8.01□□□□□ -1.13
PDE4D-201ENST00000309641 ATP6AP1Q15904 470 aa8.01□□□□□ -1.13
PDE4D-201ENST00000309641 ARMC4Q5T2S8 1044 aa8.01□□□□□ -1.13
PDE4D-201ENST00000309641 KLHL17Q6TDP4 642 aa8.01□□□□□ -1.13
PDE4D-201ENST00000309641 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
PDE4D-201ENST00000309641 BEND4Q6ZU67 534 aa8.01□□□□□ -1.13
PDE4D-201ENST00000309641 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
PDE4D-201ENST00000309641 SYT14Q8NB59 555 aa8.01□□□□□ -1.13
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PDE4D-201ENST00000309641 ASB10Q8WXI3 467 aa8.01□□□□□ -1.13
PDE4D-201ENST00000309641 Q96M85 177 aa8.01□□□□□ -1.13
PDE4D-201ENST00000309641 TSPAN32Q96QS1 320 aa8.01□□□□□ -1.13
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PDE4D-201ENST00000309641 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa8.01□□□□□ -1.13
PDE4D-201ENST00000309641 OR52D1Q9H346 318 aa8.01□□□□□ -1.13
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PDE4D-201ENST00000309641 ASB6Q9NWX5 421 aa8.01□□□□□ -1.13
PDE4D-201ENST00000309641 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
PDE4D-201ENST00000309641 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
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PDE4D-201ENST00000309641 ABCA4P78363 2273 aa8.01□□□□□ -1.13
PDE4D-201ENST00000309641 ABCA12Q86UK0 2595 aa8.01□□□□□ -1.13
PDE4D-201ENST00000309641 ITPR2Q14571 2701 aa8□□□□□ -1.13
PDE4D-201ENST00000309641 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa8□□□□□ -1.13
PDE4D-201ENST00000309641 HTR3EA5X5Y0 456 aa8□□□□□ -1.13
PDE4D-201ENST00000309641 H7C1C5 153 aa8□□□□□ -1.13
PDE4D-201ENST00000309641 M0R3G1 203 aa8□□□□□ -1.13
PDE4D-201ENST00000309641 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
PDE4D-201ENST00000309641 SEC14L2O76054 403 aa8□□□□□ -1.13
PDE4D-201ENST00000309641 BCL10O95999 233 aa8□□□□□ -1.13
PDE4D-201ENST00000309641 TP53P04637 393 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
PDE4D-201ENST00000309641 COX5AP20674 150 aa8□□□□□ -1.13
PDE4D-201ENST00000309641 RPL4P36578 427 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
PDE4D-201ENST00000309641 LCN6P62502 163 aa8□□□□□ -1.13
PDE4D-201ENST00000309641 MYBPC1Q00872 1141 aa8□□□□□ -1.13
PDE4D-201ENST00000309641 TSPAN31Q12999 210 aa8□□□□□ -1.13
PDE4D-201ENST00000309641 ITGADQ13349 1161 aa8□□□□□ -1.13
PDE4D-201ENST00000309641 SFRP5Q5T4F7 317 aa8□□□□□ -1.13
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF787Q6DD87 383 aa8□□□□□ -1.13
PDE4D-201ENST00000309641 FAM122BQ7Z309 247 aa8□□□□□ -1.13
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
PDE4D-201ENST00000309641 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa8□□□□□ -1.13
PDE4D-201ENST00000309641 HTRA1Q92743 480 aa8□□□□□ -1.13
PDE4D-201ENST00000309641 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
PDE4D-201ENST00000309641 SAMD8Q96LT4 415 aa8□□□□□ -1.13
PDE4D-201ENST00000309641 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa8□□□□□ -1.13
PDE4D-201ENST00000309641 YY1AP1Q9H869 796 aa8□□□□□ -1.13
PDE4D-201ENST00000309641 CRIM1Q9NZV1 1036 aa8□□□□□ -1.13
PDE4D-201ENST00000309641 UPB1Q9UBR1 384 aa8□□□□□ -1.13
PDE4D-201ENST00000309641 APCP25054 2843 aa8□□□□□ -1.13
PDE4D-201ENST00000309641 A0A1W2PR80 420 aa8□□□□□ -1.13
PDE4D-201ENST00000309641 A0A1W2PRG6 482 aa8□□□□□ -1.13
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PDE4D-201ENST00000309641 C16orf97H3BN30 126 aa8□□□□□ -1.13
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PDE4D-201ENST00000309641 PPP1R3DO95685 299 aa8□□□□□ -1.13
PDE4D-201ENST00000309641 THBDP07204 575 aa8□□□□□ -1.13
PDE4D-201ENST00000309641 CD14P08571 375 aa8□□□□□ -1.13
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PDE4D-201ENST00000309641 PGA3P0DJD8 388 aa8□□□□□ -1.13
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PDE4D-201ENST00000309641 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa8□□□□□ -1.13
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PDE4D-201ENST00000309641 LRFN4Q6PJG9 635 aa8□□□□□ -1.13
PDE4D-201ENST00000309641 SMARCD3Q6STE5 483 aa8□□□□□ -1.13
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PDE4D-201ENST00000309641 C20orf196Q8IYI0 205 aa8□□□□□ -1.13
PDE4D-201ENST00000309641 OR6X1Q8NH79 312 aa8□□□□□ -1.13
PDE4D-201ENST00000309641 FANK1Q8TC84 345 aa8□□□□□ -1.13
PDE4D-201ENST00000309641 S100PBPQ96BU1 408 aa8□□□□□ -1.13
PDE4D-201ENST00000309641 RASD2Q96D21 266 aa8□□□□□ -1.13
PDE4D-201ENST00000309641 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
PDE4D-201ENST00000309641 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
PDE4D-201ENST00000309641 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
PDE4D-201ENST00000309641 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
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PDE4D-201ENST00000309641 CRLF2Q9HC73 371 aa8□□□□□ -1.13
PDE4D-201ENST00000309641 ELOVL5Q9NYP7 299 aa8□□□□□ -1.13
PDE4D-201ENST00000309641 TUBAL3A6NHL2 446 aa7.99□□□□□ -1.13
PDE4D-201ENST00000309641 KRT33AO76009 404 aa7.99□□□□□ -1.13
PDE4D-201ENST00000309641 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PDE4D-201ENST00000309641 IFNGR2P38484 337 aa7.99□□□□□ -1.13
PDE4D-201ENST00000309641 DAPP51397 102 aa7.99□□□□□ -1.13
PDE4D-201ENST00000309641 PRPS1P60891 318 aa7.99□□□□□ -1.13
PDE4D-201ENST00000309641 RPL27P61353 136 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PDE4D-201ENST00000309641 P2RY6Q15077 328 aa7.99□□□□□ -1.13
PDE4D-201ENST00000309641 CEACAM16Q2WEN9 425 aa7.99□□□□□ -1.13
PDE4D-201ENST00000309641 RFX4Q33E94 735 aa7.99□□□□□ -1.13
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