RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262605.8

TTPAL-201, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPAL, Length 6,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-201ENST00000262605 ELP5Q8TE02 316 aa9.39□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 ENKD1Q9H0I2 346 aa9.39□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 GGT3PA6NGU5 568 aa9.38□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 OR6C70A6NIJ9 312 aa9.38□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa9.38□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 MASP2O00187 686 aa9.38□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 PITPNBP48739 271 aa9.38□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 C9orf40Q8IXQ3 194 aa9.38□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 CDCA4Q9BXL8 241 aa9.38□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 ABCG5Q9H222 651 aa9.38□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 SIGLEC7Q9Y286 467 aa9.38□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 KLK4Q9Y5K2 254 aa9.38□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 CKAP5Q14008 2032 aa9.38□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa9.38□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 SLC43A1O75387 559 aa9.38□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 IL1AP01583 271 aa9.38□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 MSX1P28360 303 aa9.38□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 BCAP31P51572 246 aa9.38□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 ZNF74Q16587 644 aa9.38□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 C5orf46Q6UWT4 87 aa9.38□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 SYT9Q86SS6 491 aa9.38□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 YIPF6Q96EC8 236 aa9.38□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 CHST2Q9Y4C5 530 aa9.38□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 V9GY05 133 aa9.38□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 CCDC187A0A096LP49 1063 aa9.38□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 SLC16A9Q7RTY1 509 aa9.38□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 CLDN22Q8N7P3 220 aa9.38□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 CT55Q8WUE5 264 aa9.38□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 FKRPQ9H9S5 495 aa9.38□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 CENPBD1B2RD01 187 aa9.38□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 HMGA2P52926 109 aa9.38□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 XKRXQ6PP77 449 aa9.38□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 GPA33Q99795 319 aa9.38□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 CORINQ9Y5Q5 1042 aa9.38□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 ANKUB1A6NFN9 424 aa9.38□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 ARPC4P59998 168 aa9.38□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 TEKQ02763 1124 aa9.38□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 INSL4Q14641 139 aa9.38□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 DEFB109BQ30KR1 87 aa9.38□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 SLC25A25Q6KCM7 469 aa9.38□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 FCRLAQ7L513 359 aa9.38□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 OR52N1Q8NH53 320 aa9.38□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 SAP25Q8TEE9 199 aa9.38□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 ASB17Q8WXJ9 295 aa9.38□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 DNASE2BQ8WZ79 361 aa9.38□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 THRSPQ92748 146 aa9.38□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 MOGAT1Q96PD6 335 aa9.38□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 MFRPQ9BY79 579 aa9.38□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 SLC22A11Q9NSA0 550 aa9.38□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 MYOTQ9UBF9 498 aa9.38□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 UNC13CQ8NB66 2214 aa9.38□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 RBBP9O75884 186 aa9.37□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 CD3GP09693 182 aa9.37□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 RAB3AP20336 220 aa9.37□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 SCRN3Q0VDG4 424 aa9.37□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 CDNFQ49AH0 187 aa9.37□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 CCDC32Q9BV29 185 aa9.37□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 OR10A4Q9H209 315 aa9.37□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 C1orf198Q9H425 327 aa9.37□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 REV1Q9UBZ9 1251 aa9.37□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 SLC7A11Q9UPY5 501 aa9.37□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 TMEM225BP0DP42 221 aa9.37□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 CPEP16870 476 aa9.37□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 C4BPBP20851 252 aa9.37□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 RELAQ04206 551 aa9.37□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP9.37□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 ZNF141Q15928 474 aa9.37□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 VASH2Q86V25 355 aa9.37□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa9.37□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 ZNF721Q8TF20 911 aa9.37□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 P4HTMQ9NXG6 502 aa9.37□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 KCNG2Q9UJ96 466 aa9.37□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa9.37□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 OIP5O43482 229 aa9.37□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 CELA2AP08217 269 aa9.37□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 FABP5Q01469 135 aa9.37□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 MALLQ13021 153 aa9.37□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 GPR50Q13585 617 aa9.37□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 NTRK2Q16620 822 aa9.37□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP9.37□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 C1QL3Q5VWW1 255 aa9.37□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 OLFML2AQ68BL7 652 aa9.37□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 LYPD4Q6UWN0 246 aa9.37□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 SLC16A14Q7RTX9 510 aa9.37□□□□□ -0.91
TTPAL-201ENST00000262605 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms