RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220888.9

TRPS1-201, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 5,480 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-201ENST00000220888 SLC22A20A6NK97 555 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 F8W036 122 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 G3V2L1 256 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 H0YIV9 168 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 P2RY10O00398 339 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 TSPAN12O95859 305 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 OR8U8P0C7N1 319 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 TPT1P13693 172 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 RPS2P15880 293 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 SLC9A3R2Q15599 337 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 BCL7AQ4VC05 210 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 SUMF2Q8NBJ7 301 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 OR2T35Q8NGX2 323 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 SLC35E1Q96K37 410 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 VAPAQ9P0L0 249 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 A0A1W2PPC4 97 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 ANKRD61A6NGH8 418 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 H0Y8X5 98 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 DVL1O14640 695 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 RAB40ALP0C0E4 278 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 ARAFP10398 606 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 GM2AP17900 193 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 NR4A2P43354 598 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 KEAP1Q14145 624 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF750Q32MQ0 723 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF718Q3SXZ3 478 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 OR11G2Q8NGC1 345 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 RAB40AQ8WXH6 277 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 C8orf44Q96CB5 159 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 FBXO17Q96EF6 278 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 TECTBQ96PL2 329 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 LYRM4Q9HD34 91 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 A0A1B0GWA3 101 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 SPDEFO95238 335 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 PIPP12273 146 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 HLA-BQ31612 363 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 CATSPERDQ86XM0 798 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 GCNT2Q8N0V5 402 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 ABHD11Q8NFV4 315 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF75AQ96N20 296 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 SLC39A9Q9NUM3 307 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 HRH3Q9Y5N1 445 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 OR6C76A6NM76 312 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 CAPNS1P04632 268 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 CPEP16870 476 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 IVDP26440 423 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 HTR2CP28335 458 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 SLC22A24Q8N4F4 322 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 ISYNA1Q9NPH2 558 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF225Q9UK10 706 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 R4GN57 208 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 FMN2Q9NZ56 1722 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 FAM90A27PA6NNH2 459 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 NUDT19A8MXV4 375 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 MT-CO3P00414 261 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 GLRA1P23415 457 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 RAP2BP61225 183 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 OR2A2Q6IF42 318 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 DHRS13Q6UX07 377 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 TMIGD2Q96BF3 282 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 FUNDC2Q9BWH2 189 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 OR52A1Q9UKL2 312 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 ARNTLO00327 626 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 RAB6AP20340 208 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 BMI1P35226 326 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 RTL8BQ17RB0 113 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 TMEM211Q6ICI0 200 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 RFLNAQ6ZTI6 216 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 KMT5CQ86Y97 462 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 SLC35A4Q96G79 324 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 EGLN2Q96KS0 407 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 CSF3RQ99062 836 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 S1PR3Q99500 378 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 SEMA4CQ9C0C4 833 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 CLMPQ9H6B4 373 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 TUBG2Q9NRH3 451 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 LUZP4Q9P127 313 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 MUTYHQ9UIF7 546 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 RPA2P15927 270 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 PRKACAP17612 351 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 CSNK1G2P78368 415 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 GGTA1PQ4G0N0 100 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 SLC48A1Q6P1K1 146 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 ABHD17CQ6PCB6 329 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-201ENST00000220888 CAMKMTQ7Z624 323 aa9.72□□□□□ -0.85
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