RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 SLC1A3P43003 542 aa18.6■□□□□ 0.57
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CTDP1-208ENST00000613122 PM20D2Q8IYS1 436 aa18.6■□□□□ 0.57
CTDP1-208ENST00000613122 COQ10AQ96MF6 247 aa18.6■□□□□ 0.57
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CTDP1-208ENST00000613122 A0A1W2PPV4 95 aa18.6■□□□□ 0.57
CTDP1-208ENST00000613122 MKRN2OSH3BPM6 223 aa18.6■□□□□ 0.57
CTDP1-208ENST00000613122 DSCR3O14972 297 aa18.6■□□□□ 0.57
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CTDP1-208ENST00000613122 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.57
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CTDP1-208ENST00000613122 TRIB1Q96RU8 372 aa18.58■□□□□ 0.57
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CTDP1-208ENST00000613122 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
CTDP1-208ENST00000613122 KMT5CQ86Y97 462 aa18.58■□□□□ 0.56
CTDP1-208ENST00000613122 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
CTDP1-208ENST00000613122 SCCPDHQ8NBX0 429 aa18.58■□□□□ 0.56
CTDP1-208ENST00000613122 NRIP3Q9NQ35 241 aa18.58■□□□□ 0.56
CTDP1-208ENST00000613122 ASF1BQ9NVP2 202 aa18.58■□□□□ 0.56
CTDP1-208ENST00000613122 CHRNA9Q9UGM1 479 aa18.58■□□□□ 0.56
CTDP1-208ENST00000613122 FZD7O75084 574 aa18.57■□□□□ 0.56
CTDP1-208ENST00000613122 GRPP07492 148 aa18.57■□□□□ 0.56
CTDP1-208ENST00000613122 SELEP16581 610 aa18.57■□□□□ 0.56
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