RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559460.5

SMAD3-211, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-211ENST00000559460 RAB1AP62820 205 aa8.14□□□□□ -1.11
SMAD3-211ENST00000559460 GUCY2DQ02846 1103 aa8.14□□□□□ -1.11
SMAD3-211ENST00000559460 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
SMAD3-211ENST00000559460 TMEM155Q4W5P6 130 aa8.14□□□□□ -1.11
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF385BQ569K4 471 aa8.14□□□□□ -1.11
SMAD3-211ENST00000559460 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
SMAD3-211ENST00000559460 FOXB2Q5VYV0 432 aa8.14□□□□□ -1.11
SMAD3-211ENST00000559460 EMBQ6PCB8 327 aa8.14□□□□□ -1.11
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF813Q6ZN06 617 aa8.14□□□□□ -1.11
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SMAD3-211ENST00000559460 TSPAN32Q96QS1 320 aa8.14□□□□□ -1.11
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SMAD3-211ENST00000559460 ACSS3Q9H6R3 686 aa8.14□□□□□ -1.11
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SMAD3-211ENST00000559460 GPR45Q9Y5Y3 372 aa8.14□□□□□ -1.11
SMAD3-211ENST00000559460 KCNE3Q9Y6H6 103 aa8.14□□□□□ -1.11
SMAD3-211ENST00000559460 BIRC6Q9NR09 4857 aa8.14□□□□□ -1.11
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SMAD3-211ENST00000559460 IGHV2-70P01814 119 aa8.13□□□□□ -1.11
SMAD3-211ENST00000559460 UROSP10746 265 aa8.13□□□□□ -1.11
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SMAD3-211ENST00000559460 Q6ZSV7 163 aa8.13□□□□□ -1.11
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SMAD3-211ENST00000559460 TSSK3Q96PN8 268 aa8.13□□□□□ -1.11
SMAD3-211ENST00000559460 KCNA7Q96RP8 456 aa8.13□□□□□ -1.11
SMAD3-211ENST00000559460 OSBPL9Q96SU4 736 aa8.13□□□□□ -1.11
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SMAD3-211ENST00000559460 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
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SMAD3-211ENST00000559460 RAD51CO43502 376 aa8.12□□□□□ -1.11
SMAD3-211ENST00000559460 ENTPD5O75356 428 aa8.12□□□□□ -1.11
SMAD3-211ENST00000559460 UBOX5O94941 541 aa8.12□□□□□ -1.11
SMAD3-211ENST00000559460 GSTA1P08263 222 aa8.12□□□□□ -1.11
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SMAD3-211ENST00000559460 PMS2P3Q13401 168 aa8.12□□□□□ -1.11
SMAD3-211ENST00000559460 TBC1D28Q2M2D7 210 aa8.12□□□□□ -1.11
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SMAD3-211ENST00000559460 MTERF3Q96E29 417 aa8.12□□□□□ -1.11
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SMAD3-211ENST00000559460 SLC19A3Q9BZV2 496 aa8.12□□□□□ -1.11
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SMAD3-211ENST00000559460 LRMDAQ9H2I8 198 aa8.12□□□□□ -1.11
SMAD3-211ENST00000559460 TOR3AQ9H497 397 aa8.12□□□□□ -1.11
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SMAD3-211ENST00000559460 PLXNB1O43157 2135 aa8.12□□□□□ -1.11
SMAD3-211ENST00000559460 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa8.12□□□□□ -1.11
SMAD3-211ENST00000559460 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa8.11□□□□□ -1.11
SMAD3-211ENST00000559460 ANKRD61A6NGH8 418 aa8.11□□□□□ -1.11
SMAD3-211ENST00000559460 TM9SF1O15321 606 aa8.11□□□□□ -1.11
SMAD3-211ENST00000559460 FCMRO60667 390 aa8.11□□□□□ -1.11
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