RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523636.5

PABPC1-223, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, human

TSL 5

Gene PABPC1, Length 818 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PABPC1-223	ENST00000523636	RNF157	Q96PX1	679 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	CPXM1	Q96SM3	734 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	ZNF670	Q9BS34	389 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	ATG101	Q9BSB4	218 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	CHID1	Q9BWS9	393 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	HINT2	Q9BX68	163 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	BEX2	Q9BXY8	128 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	REG4	Q9BYZ8	158 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	DERL2	Q9GZP9	239 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	OR2AG1	Q9H205	316 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	ASB8	Q9H765	288 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	CCNB1IP1	Q9NPC3	277 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	EQTN	Q9NQ60	294 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	EPHA6	Q9UF33	1036 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	LOC390937	A0A1W2PQ73	354 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	DPPA5	A6NC42	116 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636		H3BMH7	237 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	INSIG1	O15503	277 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	PSMD3	O43242	534 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	LCMT2	O60294	686 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	FZD7	O75084	574 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	GPC4	O75487	556 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	ZBTB11	O95625	1053 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	SOD1	P00441	154 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	CELA2A	P08217	269 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	RPS17	P08708	135 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	SPP1	P10451	314 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	PAX1	P15863	534 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	TPSB2	P20231	275 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	UQCRC2	P22695	453 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	GCA	P28676	217 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	IL12B	P29460	328 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	MAGEA6	P43360	314 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	RGS7	P49802	495 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	PPT1	P50897	306 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	PRPS1	P60891	318 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	CDK3	Q00526	305 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	HSPB3	Q12988	150 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	STX5	Q13190	355 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	GK2	Q14410	553 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	4.55	□□□□□ -1.68	3e-16	■■■■■ 34.2
PABPC1-223	ENST00000523636	TPSAB1	Q15661	275 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	EXT1	Q16394	746 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	CARTPT	Q16568	116 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	FNBP1L	Q5T0N5	605 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	RNLS	Q5VYX0	342 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	GDPD4	Q6W3E5	623 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	MAVS	Q7Z434	540 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	RBM45	Q8IUH3	476 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	CRLF3	Q8IUI8	442 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	NUDCD3	Q8IVD9	361 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	GTPBP8	Q8N3Z3	284 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	C3orf56	Q8N813	242 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	RELL2	Q8NC24	303 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	PPFIBP2	Q8ND30	876 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	JOSD2	Q8TAC2	188 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	LINC01560	Q8TB33	94 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	FAM172A	Q8WUF8	416 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	DCAKD	Q8WVC6	231 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	SLC44A1	Q8WWI5	657 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	RAD51AP1	Q96B01	352 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	MOAP1	Q96BY2	351 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	ZBED6CL	Q96FA7	236 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	SIGLEC12	Q96PQ1	595 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	OR2M4	Q96R27	311 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	GBA3	Q9H227	469 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	RAB9B	Q9NP90	201 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	PIGL	Q9Y2B2	252 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636		A0A1W2PRB8	838 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	TCRBV9S1A1T	A0A576	114 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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