RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504431.1

UBE2B-204, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 2

Gene UBE2B, Length 235 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-204ENST00000504431 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa6.65□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 A0A1B0GVC2 190 aa6.64□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 SERINC4A6NH21 518 aa6.64□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 AP3D1O14617 1153 aa6.64□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 MRASO14807 208 aa6.64□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 SEC14L5O43304 696 aa6.64□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 EFNA2O43921 213 aa6.64□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 STSP08842 583 aa6.64□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 GKN3PP0CG01 181 aa6.64□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 COX4I1P13073 169 aa6.64□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 CCNA2P20248 432 aa6.64□□□□□ -1.35
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UBE2B-204ENST00000504431 CA7P43166 264 aa6.64□□□□□ -1.35
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UBE2B-204ENST00000504431 B3GALT5-AS1P59052 145 aa6.64□□□□□ -1.35
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UBE2B-204ENST00000504431 TMEM268Q5VZI3 342 aa6.64□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 NANOGP8Q6NSW7 305 aa6.64□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 TMEM81Q6P7N7 255 aa6.64□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 AAGABQ6PD74 315 aa6.64□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 ZNF836Q6ZNA1 936 aa6.64□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa6.64□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 PIGWQ7Z7B1 504 aa6.64□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 IFNEQ86WN2 208 aa6.64□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
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UBE2B-204ENST00000504431 NANOGP1Q8N7R0 232 aa6.64□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 OR10A6Q8NH74 314 aa6.64□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa6.64□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
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UBE2B-204ENST00000504431 ANKRD27Q96NW4 1050 aa6.64□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 CCT8L2Q96SF2 557 aa6.64□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 CGREF1Q99674 301 aa6.64□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 OR2B2Q9GZK3 357 aa6.64□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 NANOGQ9H9S0 305 aa6.64□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 ACKR4Q9NPB9 350 aa6.64□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 TMEM160Q9NX00 188 aa6.64□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 ABCG2Q9UNQ0 655 aa6.64□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 MEMO1Q9Y316 297 aa6.64□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 L3MBTL1Q9Y468 752 aa6.64□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa6.64□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 MYO18BQ8IUG5 2567 aa6.63□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 OR2M5A3KFT3 312 aa6.63□□□□□ -1.35
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UBE2B-204ENST00000504431 C5orf58C9J3I9 102 aa6.63□□□□□ -1.35
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UBE2B-204ENST00000504431 CCDC22O60826 627 aa6.63□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 CSTAP01040 98 aa6.63□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 OPN1SWP03999 348 aa6.63□□□□□ -1.35
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UBE2B-204ENST00000504431 SHC1P29353 583 aa6.63□□□□□ -1.35
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UBE2B-204ENST00000504431 CLDN20P56880 219 aa6.63□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 NUP107P57740 925 aa6.63□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 PSPHP78330 225 aa6.63□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 KCNJ10P78508 379 aa6.63□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 ADORA2A-AS1P86434 159 aa6.63□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 FOXF1Q12946 379 aa6.63□□□□□ -1.35
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UBE2B-204ENST00000504431 WLSQ5T9L3 541 aa6.63□□□□□ -1.35
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UBE2B-204ENST00000504431 PTOV1Q86YD1 416 aa6.63□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 SCAIQ8N9R8 606 aa6.63□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa6.63□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 OR52P1PQ8NH57 321 aa6.63□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 GPR119Q8TDV5 335 aa6.63□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 LRRC58Q96CX6 371 aa6.63□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 RNFT2Q96EX2 444 aa6.63□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 RNF145Q96MT1 663 aa6.63□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 WFDC6Q9BQY6 131 aa6.63□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 CTDSP1Q9GZU7 261 aa6.63□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 HOXD1Q9GZZ0 328 aa6.63□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
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