RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495802.5

SKAP2-208, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 554 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-208	ENST00000495802	LRRC74B	Q6ZQY2	392 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	ZNF429	Q86V71	674 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	ARIH2OS	Q8N7S6	290 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	FBXO32	Q969P5	355 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	RNF185	Q96GF1	192 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	OR8B4	Q96RC9	309 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	SPATA7	Q9P0W8	599 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	XCL2	Q9UBD3	114 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	TRAPPC4	Q9Y296	219 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	NKX2-6	A6NCS4	301 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	FAM166B	A8MTA8	275 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	C1orf105	O95561	183 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	ALDOB	P05062	364 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	HPGD	P15428	266 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	TCN1	P20061	433 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	SLC2A5	P22732	501 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	HSD17B2	P37059	387 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	LHX2	P50458	406 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	REG3A	Q06141	175 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	FRMPD2B	Q6IN97	320 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	TRIM40	Q6P9F5	258 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802		Q6ZVH6	145 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	UBE2J2	Q8N2K1	259 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	OR4F15	Q8NGB8	312 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	SORT1	Q99523	831 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	CLMP	Q9H6B4	373 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	EXD2	Q9NVH0	621 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	SLC25A37	Q9NYZ2	338 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	SLC7A8	Q9UHI5	535 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	SLC31A2	O15432	143 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	UPK3A	O75631	287 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	PALM	O75781	387 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	TMEM50A	O95807	157 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	GKN3P	P0CG01	181 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	SLC26A3	P40879	764 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	NPBWR2	P48146	333 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	ACTR3	P61158	418 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	MECOM	Q03112	1051 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	RFX4	Q33E94	735 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	KCTD21	Q4G0X4	260 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	LCN12	Q6JVE5	192 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	CNIH2	Q6PI25	160 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	ZNF621	Q6ZSS3	439 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	THOC6	Q86W42	341 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	ZADH2	Q8N4Q0	377 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	NECAB1	Q8N987	351 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	ZNF557	Q8N988	423 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	MDS2	Q8NDY4	140 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	OR4F6	Q8NGB9	312 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	DTX3L	Q8TDB6	740 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	IL22RA2	Q969J5	263 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	FAM210B	Q96KR6	192 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	HSFY1	Q96LI6	401 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	ZNF285	Q96NJ3	590 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	MFF	Q9GZY8	342 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	METTL7A	Q9H8H3	244 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	DEC1	Q9P2X7	70 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	IKZF2	Q9UKS7	526 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	HEBP2	Q9Y5Z4	205 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	WSB1	Q9Y6I7	421 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802		A0A0U1RQS6	177 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	PSTPIP1	O43586	416 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	MGRN1	O60291	552 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	IGHV2-5	P01817	119 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	C2	P06681	752 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	SLC2A3	P11169	496 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	KITLG	P21583	273 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	GPR6	P46095	362 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	FZD2	Q14332	565 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	KDM7A	Q6ZMT4	941 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	CAMK2N1	Q7Z7J9	78 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	ENTHD1	Q8IYW4	607 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	OR2L3	Q8NG85	312 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	MCOLN3	Q8TDD5	553 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SKAP2-208	ENST00000495802	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91

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