RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477563.6

RBBP4-211, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, humanhuman

TSL 5

Gene RBBP4, Length 544 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4-211ENST00000477563 SLAMF8Q9P0V8 285 aa6.66□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa6.66□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 TMED7Q9Y3B3 224 aa6.66□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 CHST2Q9Y4C5 530 aa6.66□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 ATP23Q9Y6H3 246 aa6.66□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 TMEM89A2RUT3 159 aa6.65□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 CCT8L1PA6NM43 557 aa6.65□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 B9A039 149 aa6.65□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 FXYD1O00168 92 aa6.65□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 NDUFAB1O14561 156 aa6.65□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 AP3D1O14617 1153 aa6.65□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 KCNAB3O43448 404 aa6.65□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 FRS3O43559 492 aa6.65□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 OR2T1O43869 369 aa6.65□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 CCDC22O60826 627 aa6.65□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 STAMBPO95630 424 aa6.65□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 IGF2P01344 180 aa6.65□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 CXCR1P25024 350 aa6.65□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 TACR3P29371 465 aa6.65□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 RYKP34925 604 aa6.65□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 PPOXP50336 477 aa6.65□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 CDH15P55291 814 aa6.65□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 SLC25A3Q00325 362 aa6.65□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 GUCY1A3Q02108 690 aa6.65□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 KLF10Q13118 480 aa6.65□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 NFYCQ13952 458 aa6.65□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 SLC17A1Q14916 467 aa6.65□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 EFNB3Q15768 340 aa6.65□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 C3orf36Q3SXR2 165 aa6.65□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 CGB2Q6NT52 195 aa6.65□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 ERICH5Q6P6B1 374 aa6.65□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 ZNF613Q6PF04 617 aa6.65□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 CCDC80Q76M96 950 aa6.65□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 VRK2Q86Y07 508 aa6.65□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 PTOV1Q86YD1 416 aa6.65□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 UBE2J2Q8N2K1 259 aa6.65□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 CLIP4Q8N3C7 705 aa6.65□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 LINC01356Q8N9X3 169 aa6.65□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa6.65□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 MFSD8Q8NHS3 518 aa6.65□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 NFKBIDQ8NI38 313 aa6.65□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 C10orf82Q8WW14 230 aa6.65□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 MAL2Q969L2 176 aa6.65□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 C3orf49Q96BT1 292 aa6.65□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 ARL5BQ96KC2 179 aa6.65□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 PCDHAC1Q9H158 963 aa6.65□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 PLK3Q9H4B4 646 aa6.65□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 IKZF5Q9H5V7 419 aa6.65□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 RLIMQ9NVW2 624 aa6.65□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 GID8Q9NWU2 228 aa6.65□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 CAPN7Q9Y6W3 813 aa6.65□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.64□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa6.64□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 A0A1W2PR80 420 aa6.64□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 TMEM72A0PK05 275 aa6.64□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 LIPT2A6NK58 231 aa6.64□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 AQP7P3A6NL99 342 aa6.64□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 FBP2O00757 339 aa6.64□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 MFN2O95140 757 aa6.64□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 VENTXO95231 258 aa6.64□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 IGHV3-9P01782 118 aa6.64□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 TFPIP10646 304 aa6.64□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 SERPINF1P36955 418 aa6.64□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 GZMMP51124 257 aa6.64□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 CHN2P52757 468 aa6.64□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 NCALDP61601 193 aa6.64□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 TGFBR3Q03167 851 aa6.64□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 RIN1Q13671 783 aa6.64□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 CYP51A1Q16850 503 aa6.64□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 VMACQ2NL98 169 aa6.64□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 MMEL1Q495T6 779 aa6.64□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 IQCCQ4KMZ1 466 aa6.64□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 C1orf140Q5VVS0 124 aa6.64□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 NANOGP8Q6NSW7 305 aa6.64□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 ULK3Q6PHR2 472 aa6.64□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 HACD2Q6Y1H2 254 aa6.64□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 CALHM3Q86XJ0 350 aa6.64□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 TREML1Q86YW5 311 aa6.64□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 ARMC8Q8IUR7 673 aa6.64□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 C10orf111Q8N326 155 aa6.64□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 OR52E4Q8NGH9 312 aa6.64□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 FAM216AQ8WUB2 273 aa6.64□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 SLC38A4Q969I6 547 aa6.64□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 LRRC58Q96CX6 371 aa6.64□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 FBXO17Q96EF6 278 aa6.64□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 SLC47A1Q96FL8 570 aa6.64□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 EPYCQ99645 322 aa6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms