RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 WASH6PQ9NQA3 447 aa6.21□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 IL17CQ9P0M4 197 aa6.21□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 LAMP3Q9UQV4 416 aa6.21□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 GPR45Q9Y5Y3 372 aa6.21□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 RGPD2P0DJD1 1756 aa6.21□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 MEIS3P1A6NDR6 274 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 LDB3O75112 727 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 MBP02144 154 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 RPS17P08708 135 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 PAX6P26367 422 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 TNFSF8P32971 234 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 HOXD12P35452 270 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 HOXD13P35453 343 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 KIR2DS4P43632 304 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 OR1D4P47884 311 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 KIR2DS1Q14954 304 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 DEFB110Q30KQ9 67 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 IL20RBQ6UXL0 311 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 GDPD3Q7L5L3 318 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 LSMEM2Q8N112 164 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 ACPTQ9BZG2 426 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 ULBP3Q9BZM4 244 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 EMC7Q9NPA0 242 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 NALCNQ8IZF0 1738 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 PPP1R2P9O14990 202 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 B4GAT1O43505 415 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 SDC3O75056 442 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 GLCEO94923 617 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 MTNR1BP49286 362 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 CLDN10P78369 228 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 PRR22Q8IZ63 422 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 ZNRF4Q8WWF5 429 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 LINC01599Q8WXQ3 324 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 BORCS6Q96GS4 357 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 SLC22A12Q96S37 553 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 PIGMQ9H3S5 423 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 KCMF1Q9P0J7 381 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 MMACHCQ9Y4U1 282 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 SMCHD1A6NHR9 2005 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 PIK3C2AO00443 1686 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 A0A1W2PQ09 198 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 PPP5D1E7EU14 171 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 STMND1H3BQB6 276 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 MT-ATP6P00846 226 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 F3P13726 295 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 GPX3P22352 226 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 GABRB3P28472 473 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 CD70P32970 193 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 RAB38P57729 211 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 NPY5RQ15761 445 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 EXT1Q16394 746 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 OR7E24Q6IFN5 339 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 LGI3Q8N145 548 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 LRRC18Q8N456 261 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 PARP16Q8N5Y8 322 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 OR10J5Q8NHC4 309 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 STT3BQ8TCJ2 826 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 SLC35A4Q96G79 324 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 TRIB1Q96RU8 372 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 SOX7Q9BT81 388 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 TAAR5O14804 337 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 YY2O15391 372 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 SIRPAP78324 504 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 TNFRSF17Q02223 184 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 SLC9A3R2Q15599 337 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 GGTA1PQ4G0N0 100 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 DPPA2Q7Z7J5 298 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 YIPF5Q969M3 257 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 SLC35E1Q96K37 410 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 IP6K3Q96PC2 410 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 ALG12Q9BV10 488 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 SCN9AQ15858 1988 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 GIPRP48546 466 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 IL10RAQ13651 578 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 STEAP1BQ6NZ63 245 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 VHLLQ6RSH7 139 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa6.2□□□□□ -1.42
USP46-201ENST00000441222 C1orf87Q8N0U7 546 aa6.2□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms