RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411398.1

RNU6-1052P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1052, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1052P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SLC9A3R2Q15599 337 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CEBPEQ15744 281 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 POU2AF1Q16633 256 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SLC25A52Q3SY17 297 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TMEM52BQ4KMG9 183 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RILPL1Q5EBL4 403 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CCDC158Q5M9N0 1113 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 FAM91A1Q658Y4 838 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SCYL2Q6P3W7 929 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PLBD1Q6P4A8 553 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TBPL2Q6SJ96 375 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 AFTPHQ6ULP2 937 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SLC16A13Q7RTY0 426 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SLC22A16Q86VW1 577 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 IQCA1Q86XH1 822 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SBSPONQ8IVN8 264 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PIANPQ8IYJ0 282 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TMEM256Q8N2U0 113 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PAQR8Q8TEZ7 354 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 FAHD2AQ96GK7 314 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SEC22AQ96IW7 307 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ELMO2Q96JJ3 720 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 DNAJC30Q96LL9 226 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ODF3Q96PU9 254 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RSG1Q9BU20 258 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 KRT23Q9C075 422 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NIT2Q9NQR4 276 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 BABAM2Q9NXR7 383 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 GPR34Q9UPC5 381 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RNF6Q9Y252 685 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 C22orf24Q9Y442 160 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 COMMD10Q9Y6G5 202 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NCKAP5O14513 1909 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TTC26A0AVF1 554 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 OR6C65A6NJZ3 312 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 UGT1A9O60656 530 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 IGKV5-2P06315 115 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 GKN3PP0CG01 181 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 LBPP18428 481 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ATP6V1B2P21281 511 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PTAFRP25105 342 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ADSSP30520 456 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CEACAM6P40199 344 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 AQP2P41181 271 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NPY2RP49146 381 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PRLHRP49683 370 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TCP10Q12799 353 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CST6Q15828 149 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ZNF699Q32M78 642 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PARP15Q460N3 678 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ALFQ53S48 1182 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 YIF1BQ5BJH7 314 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SPINK6Q6UWN8 80 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ZNF493Q6ZR52 646 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 C1orf186Q6ZWK4 172 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CPXCR1Q8N123 301 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 KDM8Q8N371 416 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 IQUBQ8NA54 791 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 VN1R2Q8NFZ6 395 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SLC2A14Q8TDB8 520 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CCDC51Q96ER9 411 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TBCDQ9BTW9 1192 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CHCHD7Q9BUK0 85 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 UGT1A7Q9HAW7 530 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 UGT1A10Q9HAW8 530 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 UGT1A8Q9HAW9 530 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RAB9BQ9NP90 201 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 QPCTLQ9NXS2 382 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 HOXC10Q9NYD6 342 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 C21orf62Q9NYP8 219 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SEPT10Q9P0V9 454 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 DOK5Q9P104 306 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PDZD2O15018 2839 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 HTR3EA5X5Y0 456 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 H3BTX0 84 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CHMP2AO43633 222 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 OR7C2O60412 319 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TGM6O95932 706 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP-0.8□□□□□ -2.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms