RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379215.8

ECHDC3-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHDC3, Length 1,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3-201ENST00000379215 MT-ND2P03891 347 aa22■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 DCKP27707 260 aa22■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 P2RY4P51582 365 aa22■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 POU4F2Q12837 409 aa22■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 KLHL12Q53G59 568 aa22■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 MESTQ5EB52 335 aa22■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 RNLSQ5VYX0 342 aa22■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 HBMQ6B0K9 141 aa22■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 CYB561A3Q8NBI2 242 aa22■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 BBS1Q8NFJ9 593 aa22■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF519Q8TB69 540 aa22■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 DDOQ99489 341 aa22■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 CDCA4Q9BXL8 241 aa22■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 MFRPQ9BY79 579 aa22■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 HAO2Q9NYQ3 351 aa22■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 DCHS1Q96JQ0 3298 aa22■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 AHCYL1O43865 530 aa21.99■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 RAB36O95755 333 aa21.99■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 BCL10O95999 233 aa21.99■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 PLGP00747 810 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 STSP08842 583 aa21.99■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF24P17028 368 aa21.99■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 ACVR1BP36896 505 aa21.99■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 ALDH3B2P48448 385 aa21.99■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 CARD18P57730 90 aa21.99■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 RPS7P62081 194 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 PIGFQ07326 219 aa21.99■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 MEIOBQ8N635 442 aa21.99■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 SLC39A7Q92504 469 aa21.99■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 ADGRG7Q96K78 797 aa21.99■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 TUBA1CQ9BQE3 449 aa21.99■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa21.99■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 OR51V1Q9H2C8 321 aa21.99■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 TFECO14948 347 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 SLC2A5P22732 501 aa21.98■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 TTKP33981 857 aa21.98■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 ATP6V1E1P36543 226 aa21.98■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 C1DQ13901 141 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 PON3Q15166 354 aa21.98■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 POU4F3Q15319 338 aa21.98■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 SLC35D2Q76EJ3 337 aa21.98■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 OR2T4Q8NH00 348 aa21.98■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 LGALS12Q96DT0 336 aa21.98■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 MED20Q9H944 212 aa21.98■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 NDUFA13Q9P0J0 144 aa21.98■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 B3GAT1Q9P2W7 334 aa21.98■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 MOKQ9UQ07 419 aa21.98■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa21.98■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 OR6C68A6NDL8 312 aa21.98■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 ARHGEF9O43307 516 aa21.98■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 CELA3AP09093 270 aa21.98■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 ENPP1P22413 925 aa21.98■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 SLC16A1P53985 500 aa21.98■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 CLDN20P56880 219 aa21.98■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 INAQ16352 499 aa21.98■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 Q6ZS92 163 aa21.98■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 NEIL3Q8TAT5 605 aa21.98■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 ASB10Q8WXI3 467 aa21.98■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 TEAD3Q99594 435 aa21.98■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 HCAR1Q9BXC0 346 aa21.98■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 SLC6A15Q9H2J7 730 aa21.98■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 LDAHQ9H6V9 325 aa21.98■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 RAXQ9Y2V3 346 aa21.98■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 PRSS37A4D1T9 235 aa21.97■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 ITGB2P05107 769 aa21.97■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 IFNGR1P15260 489 aa21.97■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF43P17038 809 aa21.97■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 MYL12AP19105 171 aa21.97■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 PCMT1P22061 227 aa21.97■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 CENPAP49450 140 aa21.97■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 LHX2P50458 406 aa21.97■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 NEDD8Q15843 81 aa21.97■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa21.97■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa21.97■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 OR52I1Q8NGK6 324 aa21.97■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 RORBQ92753 470 aa21.97■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 CRELD1Q96HD1 420 aa21.97■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa21.97■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa21.96■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 CCDC182A6NF36 153 aa21.96■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF708P17019 499 aa21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms