RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261464.9

TRAF5-201, Transcript of TNF receptor associated factor 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAF5, Length 3,972 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF5-201ENST00000261464 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 ZNF628Q5EBL2 1059 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 XAF1Q6GPH4 301 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 CORO6Q6QEF8 472 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 OR13C5Q8NGS8 318 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 TM9SF4Q92544 642 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 TRIM63Q969Q1 353 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 MVB12AQ96EY5 273 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 SLC41A2Q96JW4 573 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 LHX9Q9NQ69 397 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 POLE3Q9NRF9 147 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 CMC2Q9NRP2 79 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 MED29Q9NX70 200 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 ZNF639Q9UID6 485 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 FBXL3Q9UKT7 428 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 ACAD8Q9UKU7 415 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 CENPBD1B2RD01 187 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 TBX19O60806 448 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 NKX2-2O95096 273 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 IFNGR1P15260 489 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 GRK5P34947 590 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 FASLGP48023 281 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 CSNK1A1P48729 337 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 PITPNBP48739 271 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 SSR4P51571 173 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 MVDP53602 400 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 NKPD1Q17RQ9 610 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 DMRTC1Q5HYR2 192 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 UBE2UQ5VVX9 321 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 LIPNQ5VXI9 398 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 STEAP3Q658P3 488 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 SLC25A24Q6NUK1 477 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 BEST4Q8NFU0 473 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 ACOT12Q8WYK0 555 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 WFDC6Q9BQY6 131 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 OR10A4Q9H209 315 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 NUDT15Q9NV35 164 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 V9GY05 133 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 A6NIZ1 184 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 C4orf51C9J302 202 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 LYRM1O43325 122 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 TMEM225BP0DP42 221 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 IL7P13232 177 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 HTR3AP46098 478 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 P2RX1P51575 399 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 RAP1BP61224 184 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 RAP1AP62834 184 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 RNF4P78317 190 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 ACKR1Q16570 336 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 XKRXQ6PP77 449 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 KCTD9Q7L273 389 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 GDPD1Q8N9F7 314 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 OR4Q3Q8NH05 313 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 OR5J2Q8NH18 312 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 ZNF681Q96N22 645 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 CDCA4Q9BXL8 241 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 NOX4Q9NPH5 578 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 ACOXLQ9NUZ1 547 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 FAIMQ9NVQ4 179 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 TBC1D24Q9ULP9 559 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 SATB2Q9UPW6 733 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 WDFY4Q6ZS81 3184 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 PRAMEF25A6NGN4 478 aa5.94□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 METTL15A6NJ78 407 aa5.94□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 NPIPB8E9PQR5 432 aa5.94□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 CYR61O00622 381 aa5.94□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 SURF4O15260 269 aa5.94□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 LRRTM2O43300 516 aa5.94□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 HRO43593 1189 aa5.94□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 MPIG6BO95866 241 aa5.94□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 WNT1P04628 370 aa5.94□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 ABCD3P28288 659 aa5.94□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 GPR3P46089 330 aa5.94□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 PTH2RP49190 550 aa5.94□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 STARP49675 285 aa5.94□□□□□ -1.46
TRAF5-201ENST00000261464 HMGA2P52926 109 aa5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms