RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031823.11

Herc3-201, Transcript of Hect domain and RLD 3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc3, Length 3,596 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cdk5P49615 292 aa10.69□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zdhhc2P59267 366 aa10.69□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gabarapl2P60521 117 aa10.69□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Emx1Q04742 257 aa10.69□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Arhgef39Q66JY6 344 aa10.69□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Znf182Q6P560 627 aa10.69□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rrm2bQ6PEE3 351 aa10.69□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fbxw14Q8C2Y5 466 aa10.69□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Smco1Q8CEZ1 214 aa10.69□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pom121Q8K3Z9 1200 aa10.69□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 NotumQ8R116 503 aa10.69□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn1r208Q8R275 308 aa10.69□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr820Q8VFU5 312 aa10.69□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Metap1dQ9CPW9 335 aa10.69□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mettl7a3G3X9G9 244 aa10.69□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm17019K7N6W5 255 aa10.69□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn2r36K7N741 852 aa10.69□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 MscO88940 201 aa10.69□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 TpbpaP13438 124 aa10.69□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Acvr2aP27038 513 aa10.69□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hoxd1Q01822 328 aa10.69□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc35f3Q1LZI2 421 aa10.69□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Myl12bQ3THE2 172 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ankrd28Q505D1 1053 aa10.69□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Il15raQ60819 263 aa10.69□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 BanpQ8VBU8 548 aa10.69□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rbms2Q8VC70 383 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Arl4dQ99PE9 201 aa10.69□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ier3ip1Q9CR20 82 aa10.69□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 NubplQ9CWD8 319 aa10.69□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Glipr2Q9CYL5 154 aa10.69□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Shisa5Q9D7I0 235 aa10.69□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Prg4Q9JM99 1054 aa10.69□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hipk2Q9QZR5 1196 aa10.69□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Adam11Q9R1V4 773 aa10.69□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dcaf10A2AKB9 566 aa10.68□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr1097A2AVA9 315 aa10.68□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Esp18A8R0V1 91 aa10.68□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 S100a2J3QMC7 104 aa10.68□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 9330182O14RikJ3QNB2 140 aa10.68□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 H2-ObO35424 271 aa10.68□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 EbpP70245 230 aa10.68□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Il9rQ01114 468 aa10.68□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gdpgp1Q3TLS3 386 aa10.68□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pgap1Q3UUQ7 922 aa10.68□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Snta1Q61234 503 aa10.68□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ccdc59Q8R2N0 240 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gstm4Q8R5I6 218 aa10.68□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr1090Q8VGA6 313 aa10.68□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gkn3Q9D0T7 191 aa10.68□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fam166aQ9D4K5 319 aa10.68□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 RfxankQ9Z205 269 aa10.68□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm9008E9PVG0 424 aa10.68□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cyp4a31F8WGU9 509 aa10.68□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Prps1l3G3UXL2 318 aa10.68□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Capns1O88456 269 aa10.68□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Klk1b16P04071 261 aa10.68□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rpl7P14148 270 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Adrb2P18762 418 aa10.68□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zfp36P22893 319 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lad1P57016 528 aa10.68□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lsm3P62311 102 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tbx5P70326 518 aa10.68□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fzd7Q61090 572 aa10.68□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mea1Q64327 174 aa10.68□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kng2Q6S9I3 644 aa10.68□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr967Q7TRA6 310 aa10.68□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Jazf1Q80ZQ5 243 aa10.68□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mfsd8Q8BH31 519 aa10.68□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nyap2Q8BM65 682 aa10.68□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cdhr5Q8VHF2 831 aa10.68□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 AmnQ99JB7 458 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Prps1Q9D7G0 318 aa10.68□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Plod2Q9R0B9 737 aa10.68□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 BC024063A0A1W2P7G7 749 aa10.67□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lcn11A2BHR2 178 aa10.67□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr376E9Q4M1 320 aa10.67□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm8871F7AXK2 190 aa10.67□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 P01634 136 aa10.67□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 LckP06240 509 aa10.67□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 C2cd4dP0CG09 341 aa10.67□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sftpa1P35242 248 aa10.67□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rpl18P35980 188 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rad52P43352 420 aa10.67□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 DbtP53395 482 aa10.67□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 SnrpgP62309 76 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 CtseP70269 397 aa10.67□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Prdm6Q3UZD5 596 aa10.67□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 P4ha2Q60716 537 aa10.67□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Irgm1Q60766 409 aa10.67□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nox3Q672J9 568 aa10.67□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sdhaf4Q8BTE0 104 aa10.67□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Neurl3Q8CJC5 254 aa10.67□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Spred1Q924S8 444 aa10.67□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cmtm6Q9CZ69 183 aa10.67□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Timm50Q9D880 353 aa10.67□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zfp534A2A7A1 661 aa10.67□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kiaa1324A2AFS3 1009 aa10.67□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cers1P27545 350 aa10.67□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Crmp1P97427 572 aa10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 37.4 ms