Protein–RNA interactions for Protein: Q924S8

Spred1, Sprouty-related, EVH1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spred1Q924S8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35,51■■■■□ 3,28
Spred1Q924S8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32,85■■■□□ 2,85
Spred1Q924S8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,38■■■□□ 2,77
Spred1Q924S8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
Spred1Q924S8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31,02■■■□□ 2,56
Spred1Q924S8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30,77■■■□□ 2,52
Spred1Q924S8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30,33■■■□□ 2,45
Spred1Q924S8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Spred1Q924S8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Spred1Q924S8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,89■■■□□ 2,37
Spred1Q924S8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Spred1Q924S8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Spred1Q924S8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29,67■■■□□ 2,34
Spred1Q924S8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Spred1Q924S8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Spred1Q924S8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29,31■■■□□ 2,28
Spred1Q924S8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Spred1Q924S8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Spred1Q924S8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Spred1Q924S8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28,7■■■□□ 2,18
Spred1Q924S8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28,62■■■□□ 2,17
Spred1Q924S8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28,61■■■□□ 2,17
Spred1Q924S8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Spred1Q924S8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28,52■■■□□ 2,16
Spred1Q924S8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Spred1Q924S8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,4■■■□□ 2,14
Spred1Q924S8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Spred1Q924S8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Spred1Q924S8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Spred1Q924S8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,11
Spred1Q924S8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Spred1Q924S8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Spred1Q924S8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Spred1Q924S8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Spred1Q924S8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28,03■■■□□ 2,08
Spred1Q924S8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28,02■■■□□ 2,08
Spred1Q924S8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28,02■■■□□ 2,08
Spred1Q924S8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Spred1Q924S8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Spred1Q924S8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Spred1Q924S8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Spred1Q924S8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Spred1Q924S8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Spred1Q924S8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Spred1Q924S8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27,5■■□□□ 1,99
Spred1Q924S8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27,5■■□□□ 1,99
Spred1Q924S8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Spred1Q924S8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27,41■■□□□ 1,98
Spred1Q924S8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Spred1Q924S8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27,34■■□□□ 1,97
Spred1Q924S8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Spred1Q924S8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Spred1Q924S8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Spred1Q924S8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27,17■■□□□ 1,94
Spred1Q924S8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27,16■■□□□ 1,94
Spred1Q924S8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,14■■□□□ 1,93
Spred1Q924S8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Spred1Q924S8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27,01■■□□□ 1,91
Spred1Q924S8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1,91
Spred1Q924S8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26,87■■□□□ 1,89
Spred1Q924S8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Spred1Q924S8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Spred1Q924S8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26,79■■□□□ 1,88
Spred1Q924S8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26,77■■□□□ 1,88
Spred1Q924S8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Spred1Q924S8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Spred1Q924S8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26,71■■□□□ 1,87
Spred1Q924S8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Spred1Q924S8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
Spred1Q924S8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Spred1Q924S8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26,63■■□□□ 1,85
Spred1Q924S8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Spred1Q924S8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26,54■■□□□ 1,84
Spred1Q924S8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Spred1Q924S8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,84
Spred1Q924S8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Spred1Q924S8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,48■■□□□ 1,83
Spred1Q924S8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Spred1Q924S8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26,44■■□□□ 1,82
Spred1Q924S8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26,44■■□□□ 1,82
Spred1Q924S8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Spred1Q924S8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26,38■■□□□ 1,81
Spred1Q924S8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26,36■■□□□ 1,81
Spred1Q924S8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26,35■■□□□ 1,81
Spred1Q924S8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26,33■■□□□ 1,81
Spred1Q924S8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Spred1Q924S8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Spred1Q924S8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,33■■□□□ 1,81
Spred1Q924S8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,8
Spred1Q924S8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Spred1Q924S8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26,32■■□□□ 1,8
Spred1Q924S8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Spred1Q924S8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Spred1Q924S8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Spred1Q924S8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26,2■■□□□ 1,78
Spred1Q924S8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Spred1Q924S8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26,17■■□□□ 1,78
Spred1Q924S8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
Spred1Q924S8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Spred1Q924S8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,2 ms