RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000029989.10

Rnf20-201, Transcript of E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rnf20, Length 4,154 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Olfr655E9Q252 308 aa9.96□□□□□ -0.81
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Galr3O88853 370 aa9.96□□□□□ -0.81
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Tpi1P17751 299 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Pax7P47239 503 aa9.96□□□□□ -0.81
Rnf20-201ENSMUST00000029989 S100a11P50543 98 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Atf4Q06507 349 aa9.96□□□□□ -0.81
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Atf7ip2Q3UL97 452 aa9.96□□□□□ -0.81
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Pon3Q62087 354 aa9.96□□□□□ -0.81
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Ranbp3lQ6PDH4 491 aa9.96□□□□□ -0.81
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Olfr1115Q7TR53 326 aa9.96□□□□□ -0.81
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Olfr1065Q7TR70 313 aa9.96□□□□□ -0.81
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Zar1Q80SU3 361 aa9.96□□□□□ -0.81
Rnf20-201ENSMUST00000029989 PigtQ8BXQ2 582 aa9.96□□□□□ -0.81
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Dleu7Q8CHZ8 209 aa9.96□□□□□ -0.81
Rnf20-201ENSMUST00000029989 FntbQ8K2I1 437 aa9.96□□□□□ -0.81
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Gabarapl1Q8R3R8 117 aa9.96□□□□□ -0.81
Rnf20-201ENSMUST00000029989 DhrsxQ8VBZ0 335 aa9.96□□□□□ -0.81
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Ddit4lQ8VHZ5 193 aa9.96□□□□□ -0.81
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Slc10a6Q9CXB2 373 aa9.96□□□□□ -0.81
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Q9D4G1 230 aa9.96□□□□□ -0.81
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Pnp2Q9D8C9 305 aa9.96□□□□□ -0.81
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Slc7a11Q9WTR6 502 aa9.96□□□□□ -0.81
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Ints1Q6P4S8 2195 aa9.96□□□□□ -0.81
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Pi4kaE9Q3L2 2105 aa9.96□□□□□ -0.81
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Olfr653E9PVA0 317 aa9.96□□□□□ -0.81
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Slc30a4O35149 430 aa9.96□□□□□ -0.81
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Gm45902Q3UDN3 361 aa9.96□□□□□ -0.81
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Gm10750Q3V0I0 133 aa9.96□□□□□ -0.81
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Klri2Q5DT36 248 aa9.96□□□□□ -0.81
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Cd3eapQ76KJ5 399 aa9.96□□□□□ -0.81
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Tas2r136Q7TQA8 305 aa9.96□□□□□ -0.81
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Kctd9Q80UN1 339 aa9.96□□□□□ -0.81
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Zadh2Q8BGC4 377 aa9.96□□□□□ -0.81
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Slc35d3Q8BGF8 422 aa9.96□□□□□ -0.81
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Mrpl22Q8BU88 206 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
Rnf20-201ENSMUST00000029989 A730049H05RikQ8C940 139 aa9.96□□□□□ -0.81
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Rdh16f2Q8K3M1 318 aa9.96□□□□□ -0.81
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Mfsd6lQ8R3N2 586 aa9.96□□□□□ -0.81
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Olfr340Q8VGL0 312 aa9.96□□□□□ -0.81
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Mbd3l1Q9D9H3 186 aa9.96□□□□□ -0.81
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Adat1Q9JHI2 499 aa9.96□□□□□ -0.81
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Arl6ip1Q9JKW0 203 aa9.96□□□□□ -0.81
Rnf20-201ENSMUST00000029989 CalcrlQ9R1W5 463 aa9.96□□□□□ -0.81
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Rab25Q9WTL2 213 aa9.96□□□□□ -0.81
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Oasl2Q9Z2F2 508 aa9.96□□□□□ -0.81
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Sptan1P16546 2472 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Gvin1Q80SU7 2427 aa9.96□□□□□ -0.82
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Gm28557A0A087WQQ0 336 aa9.96□□□□□ -0.82
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Tmem156A0A1D5RLR8 321 aa9.96□□□□□ -0.82
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Csf1P07141 552 aa9.96□□□□□ -0.82
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Kcnj5P48545 419 aa9.96□□□□□ -0.82
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Acod1P54987 488 aa9.96□□□□□ -0.82
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Fxyd2Q04646 70 aa9.96□□□□□ -0.82
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Secisbp2Q3U1C4 858 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
Rnf20-201ENSMUST00000029989 AhrrQ3U1U7 701 aa9.96□□□□□ -0.82
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Nxt2Q3UNA4 142 aa9.96□□□□□ -0.82
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Olfr1344Q7TQV3 321 aa9.96□□□□□ -0.82
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Pck2Q8BH04 640 aa9.96□□□□□ -0.82
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Cdk5rap1Q8BTW8 588 aa9.96□□□□□ -0.82
Rnf20-201ENSMUST00000029989 QdprQ8BVI4 241 aa9.96□□□□□ -0.82
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Rae1Q8C570 368 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Olfr820Q8VFU5 312 aa9.96□□□□□ -0.82
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Tpra1Q99MU1 369 aa9.96□□□□□ -0.82
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Psma6Q9QUM9 246 aa9.96□□□□□ -0.82
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Trav1A0A075B5Z4 110 aa9.96□□□□□ -0.82
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Fam83cA2ARK0 776 aa9.96□□□□□ -0.82
Rnf20-201ENSMUST00000029989 BC051665E9Q623 330 aa9.96□□□□□ -0.82
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Vmn1r58G3X9U3 310 aa9.96□□□□□ -0.82
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Pou3f1P21952 449 aa9.96□□□□□ -0.82
Rnf20-201ENSMUST00000029989 SnrpgP62309 76 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Slc22a20Q80UJ1 556 aa9.96□□□□□ -0.82
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Hpf1Q8CFE2 346 aa9.96□□□□□ -0.82
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Aimp2Q8R010 320 aa9.96□□□□□ -0.82
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Cox4i2Q91W29 172 aa9.96□□□□□ -0.82
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Znf639Q99KZ6 485 aa9.96□□□□□ -0.82
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Nrg4Q9WTX4 115 aa9.96□□□□□ -0.82
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Nprl2Q9WUE4 380 aa9.96□□□□□ -0.82
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Klhl15A2AAX3 604 aa9.95□□□□□ -0.82
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Kcnj1O88335 372 aa9.95□□□□□ -0.82
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Ifi204P0DOV2 619 aa9.95□□□□□ -0.82
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Hsd3b1P24815 373 aa9.95□□□□□ -0.82
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Slc9a3r1P70441 355 aa9.95□□□□□ -0.82
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Klhl21Q3U410 597 aa9.95□□□□□ -0.82
Rnf20-201ENSMUST00000029989 P4ha2Q60716 537 aa9.95□□□□□ -0.82
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Vangl1Q80Z96 526 aa9.95□□□□□ -0.82
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Hus1bQ8K572 276 aa9.95□□□□□ -0.82
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Zc3h10Q8R205 435 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Smim3Q99PE5 60 aa9.95□□□□□ -0.82
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Prl8a8Q9DAS4 241 aa9.95□□□□□ -0.82
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Tprg1lQ9DBS2 266 aa9.95□□□□□ -0.82
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Copz2Q9JHH9 205 aa9.95□□□□□ -0.82
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Olfr1018A2ASV3 311 aa9.95□□□□□ -0.82
Rnf20-201ENSMUST00000029989 A6H6Q4 206 aa9.95□□□□□ -0.82
Rnf20-201ENSMUST00000029989 BC035947B2RQY6 695 aa9.95□□□□□ -0.82
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Alox12eP55249 662 aa9.95□□□□□ -0.82
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Dgcr2P98154 548 aa9.95□□□□□ -0.82
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Spata33Q8C624 132 aa9.95□□□□□ -0.82
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Q8C784 167 aa9.95□□□□□ -0.82
Rnf20-201ENSMUST00000029989 Emc1Q8C7X2 997 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
Rnf20-201ENSMUST00000029989 BanpQ8VBU8 548 aa9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 55.9 ms