RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ces2gE9PV38 560 aa11.61□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn2r110E9PWD5 858 aa11.61□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cldn34aG3UW52 211 aa11.61□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ppt2O35448 302 aa11.61□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hsd3b6O35469 373 aa11.61□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Grk6O70293 576 aa11.61□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cd38P56528 304 aa11.61□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fabp5Q05816 135 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Teddm2Q208S0 260 aa11.61□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CmahQ61419 577 aa11.61□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp933Q6PEE4 468 aa11.61□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr527Q7TRT9 305 aa11.61□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cldn34b3Q80ZS5 209 aa11.61□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mchr1Q8JZL2 353 aa11.61□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdc73Q8JZM7 531 aa11.61□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1312Q8VF10 317 aa11.61□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Adarb1Q91ZS8 711 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krt88Q9CPR6 171 aa11.61□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lpcat2bQ9D5U0 516 aa11.61□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mllt1Q9ERL0 547 aa11.61□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ly6g6dQ9Z1Q3 135 aa11.61□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Parp4E9PYK3 1969 aa11.61□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Igkv12-38A0A0G2JEI7 115 aa11.61□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rpl7a-ps5A0A140T8L3 268 aa11.61□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp54E9PW05 585 aa11.61□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dbx2F8VQH7 377 aa11.61□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 9330182O14RikJ3QNB2 140 aa11.61□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nr4a1P12813 601 aa11.61□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prph2P15499 346 aa11.61□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdx2P43241 311 aa11.61□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gmeb2P58929 530 aa11.61□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rps7P62082 194 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pcp4l1Q6W8Q3 68 aa11.61□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dsg1cQ7TSF0 911 aa11.61□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Klhl12Q8BZM0 568 aa11.61□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr229Q8VFN5 307 aa11.61□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr522Q8VGL1 312 aa11.61□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr683Q8VGV1 319 aa11.61□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bcl7bQ921K9 202 aa11.61□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nkiras2Q9CR56 191 aa11.61□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rbm18Q9CR83 190 aa11.61□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gnpda2Q9CRC9 276 aa11.61□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam69aQ9D6I7 428 aa11.61□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Erv3Q9DAX3 200 aa11.61□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hoga1Q9DCU9 321 aa11.61□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sgk3Q9ERE3 496 aa11.61□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Asic5Q9R0Y1 495 aa11.61□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Celsr1O35161 3034 aa11.61□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Igkv9-123A0A140T8N8 117 aa11.6□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1164A2AVT5 326 aa11.6□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dbil5O09035 87 aa11.6□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ctla4P09793 223 aa11.6□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fxyd2Q04646 70 aa11.6□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Acp5Q05117 327 aa11.6□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AhrrQ3U1U7 701 aa11.6□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Wdr20Q3UWE6 569 aa11.6□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 HepacamQ640R3 418 aa11.6□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ranbp3lQ6PDH4 491 aa11.6□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ffar4Q7TMA4 361 aa11.6□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sgpp2Q810K3 354 aa11.6□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Luzp2Q8BGY3 345 aa11.6□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Iglon5Q8HW98 336 aa11.6□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cables2Q8K3M5 476 aa11.6□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q8R2K8 148 aa11.6□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Glb1lQ8VC60 646 aa11.6□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr215Q8VF82 310 aa11.6□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Chmp1b1Q99LU0 199 aa11.6□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 EcdQ9CS74 641 aa11.6□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Raet1eQ9CZQ6 251 aa11.6□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Srxn1Q9D975 136 aa11.6□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Stpg4Q9DAG5 247 aa11.6□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc16a5G5E8K6 468 aa11.6□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TpoP35419 914 aa11.6□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdh11P55288 796 aa11.6□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rit1P70426 219 aa11.6□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AdmP97297 184 aa11.6□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Opa3Q505D7 179 aa11.6□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Drd1Q61616 446 aa11.6□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Adam26bQ6IMH6 699 aa11.6□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Eid2Q6X7S9 236 aa11.6□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MkxQ8BIA3 353 aa11.6□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdkl3Q8BLF2 595 aa11.6□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc35c1Q8BLX4 363 aa11.6□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 OacylQ8BML2 685 aa11.6□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdk5rap1Q8BTW8 588 aa11.6□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ncr1Q8C567 325 aa11.6□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hpf1Q8CFE2 346 aa11.6□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr781Q8VFZ8 311 aa11.6□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Egln3Q91UZ4 239 aa11.6□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Chrm5Q920H4 532 aa11.6□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sucnr1Q99MT6 317 aa11.6□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mrpl15Q9CPR5 295 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bco1Q9JJS6 566 aa11.6□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dnaja4Q9JMC3 397 aa11.6□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Minpp1Q9Z2L6 481 aa11.6□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Phf3B2RQG2 2025 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dchs1E9PVD3 3291 aa11.6□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rasgef1aA0A0N4SVR5 498 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 A0A1Y7VIU7 259 aa11.59□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm2056J3QQ02 144 aa11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 46.5 ms