Protein–RNA interactions for Protein: P15499

Prph2, Peripherin-2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prph2P15499 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32,71■■■□□ 2,83
Prph2P15499 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,94■■■□□ 2,7
Prph2P15499 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,97■■■□□ 2,55
Prph2P15499 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,89■■■□□ 2,53
Prph2P15499 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Prph2P15499 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29,83■■■□□ 2,37
Prph2P15499 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Prph2P15499 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Prph2P15499 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29,33■■■□□ 2,29
Prph2P15499 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Prph2P15499 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Prph2P15499 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28,82■■■□□ 2,2
Prph2P15499 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Prph2P15499 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28,77■■■□□ 2,2
Prph2P15499 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Prph2P15499 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Prph2P15499 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Prph2P15499 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Prph2P15499 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Prph2P15499 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Prph2P15499 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Prph2P15499 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28,04■■■□□ 2,08
Prph2P15499 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Prph2P15499 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Prph2P15499 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27,98■■■□□ 2,07
Prph2P15499 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Prph2P15499 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Prph2P15499 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Prph2P15499 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Prph2P15499 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27,76■■■□□ 2,03
Prph2P15499 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Prph2P15499 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Prph2P15499 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Prph2P15499 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Prph2P15499 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Prph2P15499 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Prph2P15499 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27,43■■□□□ 1,98
Prph2P15499 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27,36■■□□□ 1,97
Prph2P15499 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Prph2P15499 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27,3■■□□□ 1,96
Prph2P15499 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Prph2P15499 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27,28■■□□□ 1,96
Prph2P15499 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Prph2P15499 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27,21■■□□□ 1,95
Prph2P15499 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Prph2P15499 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Prph2P15499 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Prph2P15499 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Prph2P15499 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26,93■■□□□ 1,9
Prph2P15499 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26,9■■□□□ 1,9
Prph2P15499 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Prph2P15499 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Prph2P15499 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Prph2P15499 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26,57■■□□□ 1,84
Prph2P15499 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Prph2P15499 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26,5■■□□□ 1,83
Prph2P15499 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Prph2P15499 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Prph2P15499 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26,39■■□□□ 1,82
Prph2P15499 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Prph2P15499 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,34■■□□□ 1,81
Prph2P15499 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Prph2P15499 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Prph2P15499 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Prph2P15499 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26,26■■□□□ 1,79
Prph2P15499 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Prph2P15499 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,22■■□□□ 1,79
Prph2P15499 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Prph2P15499 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Prph2P15499 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,13■■□□□ 1,77
Prph2P15499 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Prph2P15499 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Prph2P15499 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Prph2P15499 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Prph2P15499 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Prph2P15499 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25,95■■□□□ 1,74
Prph2P15499 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
Prph2P15499 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Prph2P15499 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25,86■■□□□ 1,73
Prph2P15499 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Prph2P15499 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25,82■■□□□ 1,72
Prph2P15499 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Prph2P15499 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Prph2P15499 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Prph2P15499 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Prph2P15499 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Prph2P15499 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Prph2P15499 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Prph2P15499 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Prph2P15499 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Prph2P15499 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Prph2P15499 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,6■■□□□ 1,69
Prph2P15499 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Prph2P15499 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Prph2P15499 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25,58■■□□□ 1,69
Prph2P15499 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Prph2P15499 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Prph2P15499 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25,49■■□□□ 1,67
Prph2P15499 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Prph2P15499 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25,48■■□□□ 1,67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34,5 ms