Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC9

Gnpda2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda2Q9CRC9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32,24■■■□□ 2,75
Gnpda2Q9CRC9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,56■■■□□ 2,64
Gnpda2Q9CRC9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,48
Gnpda2Q9CRC9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,49■■■□□ 2,47
Gnpda2Q9CRC9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29,45■■■□□ 2,3
Gnpda2Q9CRC9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Gnpda2Q9CRC9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Gnpda2Q9CRC9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Gnpda2Q9CRC9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28,89■■■□□ 2,22
Gnpda2Q9CRC9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Gnpda2Q9CRC9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Gnpda2Q9CRC9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Gnpda2Q9CRC9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28,37■■■□□ 2,13
Gnpda2Q9CRC9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28,36■■■□□ 2,13
Gnpda2Q9CRC9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Gnpda2Q9CRC9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Gnpda2Q9CRC9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Gnpda2Q9CRC9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Gnpda2Q9CRC9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Gnpda2Q9CRC9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Gnpda2Q9CRC9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Gnpda2Q9CRC9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
Gnpda2Q9CRC9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Gnpda2Q9CRC9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Gnpda2Q9CRC9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Gnpda2Q9CRC9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27,59■■■□□ 2,01
Gnpda2Q9CRC9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Gnpda2Q9CRC9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27,54■■■□□ 2
Gnpda2Q9CRC9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Gnpda2Q9CRC9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Gnpda2Q9CRC9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27,37■■□□□ 1,97
Gnpda2Q9CRC9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Gnpda2Q9CRC9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Gnpda2Q9CRC9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Gnpda2Q9CRC9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Gnpda2Q9CRC9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Gnpda2Q9CRC9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27,04■■□□□ 1,92
Gnpda2Q9CRC9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Gnpda2Q9CRC9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27,01■■□□□ 1,91
Gnpda2Q9CRC9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27,01■■□□□ 1,91
Gnpda2Q9CRC9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26,9■■□□□ 1,9
Gnpda2Q9CRC9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Gnpda2Q9CRC9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26,88■■□□□ 1,89
Gnpda2Q9CRC9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Gnpda2Q9CRC9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Gnpda2Q9CRC9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Gnpda2Q9CRC9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Gnpda2Q9CRC9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Gnpda2Q9CRC9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26,57■■□□□ 1,84
Gnpda2Q9CRC9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26,54■■□□□ 1,84
Gnpda2Q9CRC9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Gnpda2Q9CRC9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26,36■■□□□ 1,81
Gnpda2Q9CRC9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,8
Gnpda2Q9CRC9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Gnpda2Q9CRC9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Gnpda2Q9CRC9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26,18■■□□□ 1,78
Gnpda2Q9CRC9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Gnpda2Q9CRC9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Gnpda2Q9CRC9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26,08■■□□□ 1,77
Gnpda2Q9CRC9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
Gnpda2Q9CRC9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,04■■□□□ 1,76
Gnpda2Q9CRC9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Gnpda2Q9CRC9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Gnpda2Q9CRC9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Gnpda2Q9CRC9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Gnpda2Q9CRC9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Gnpda2Q9CRC9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Gnpda2Q9CRC9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25,91■■□□□ 1,74
Gnpda2Q9CRC9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Gnpda2Q9CRC9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,85■■□□□ 1,73
Gnpda2Q9CRC9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,84■■□□□ 1,73
Gnpda2Q9CRC9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Gnpda2Q9CRC9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Gnpda2Q9CRC9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Gnpda2Q9CRC9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Gnpda2Q9CRC9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25,6■■□□□ 1,69
Gnpda2Q9CRC9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Gnpda2Q9CRC9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Gnpda2Q9CRC9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Gnpda2Q9CRC9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Gnpda2Q9CRC9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25,46■■□□□ 1,67
Gnpda2Q9CRC9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25,45■■□□□ 1,66
Gnpda2Q9CRC9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Gnpda2Q9CRC9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Gnpda2Q9CRC9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Gnpda2Q9CRC9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Gnpda2Q9CRC9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Gnpda2Q9CRC9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Gnpda2Q9CRC9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Gnpda2Q9CRC9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Gnpda2Q9CRC9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,29■■□□□ 1,64
Gnpda2Q9CRC9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Gnpda2Q9CRC9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Gnpda2Q9CRC9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Gnpda2Q9CRC9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Gnpda2Q9CRC9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Gnpda2Q9CRC9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25,2■■□□□ 1,62
Gnpda2Q9CRC9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Gnpda2Q9CRC9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Gnpda2Q9CRC9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25,16■■□□□ 1,62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,7 ms