RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 EXO5Q9H790 373 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 OR2S2Q9NQN1 319 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 SH2B3Q9UQQ2 575 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 A0A0B4J2A0 478 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 IRGMA1A4Y4 181 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 RFPL4AA6NLU0 287 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 C9JQL5 133 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 K7ESM1 405 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 TGM5O43548 720 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 POP4O95707 220 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 SFTPCP11686 197 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 ITGA3P26006 1051 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 ATP1B3P54709 279 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 MANFP55145 182 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF763Q0D2J5 394 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 KCNAB1Q14722 419 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 ODF4Q2M2E3 257 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM220Q6QAJ8 160 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 SLC44A3Q8N4M1 653 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 STOML3Q8TAV4 291 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 C16orf78Q8WTQ4 265 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 HS6ST2Q96MM7 605 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 IP6K3Q96PC2 410 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 SOX7Q9BT81 388 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 SELENOIQ9C0D9 397 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 KCNK15Q9H427 330 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 SHPKQ9UHJ6 478 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 CEP250Q9BV73 2442 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 OR5H14A6NHG9 310 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 GFYI3L273 518 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 SLC34A2O95436 690 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 FGF19O95750 216 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 EPPINO95925 133 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 EDN3P14138 238 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 CD1CP29017 333 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 NTSP30990 170 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 TAS2R60P59551 318 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 GAMTQ14353 236 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF311Q5JNZ3 666 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 C1orf94Q6P1W5 598 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 RNF165Q6ZSG1 346 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 ABHD13Q7L211 337 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 NRMQ8IXM6 262 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 STEAP2Q8NFT2 490 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 OR4E2Q8NGC2 313 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 ARL11Q969Q4 196 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 ZG16BQ96DA0 208 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 BBS4Q96RK4 519 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 EDEM2Q9BV94 578 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 DYRK1BQ9Y463 629 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 INSL5Q9Y5Q6 135 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 PLXNA3P51805 1871 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 DBX1A6NMT0 343 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 SNRPGP15A8MWD9 76 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 GABARAPH6UMI1 98 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 IGHA1P01876 353 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 SFTA3P0C7M3 94 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 MPC1LP0DKB6 136 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 CST5P28325 142 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 CD80P33681 288 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 PNLIPRP1P54315 467 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 SHC2P98077 582 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 CNTN1Q12860 1018 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 NDUFAF6Q330K2 333 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 ARSIQ5FYB1 569 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 LY6G6FQ5SQ64 297 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 SLC25A30Q5SVS4 291 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 GDPD4Q6W3E5 623 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF836Q6ZNA1 936 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 AKR1E2Q96JD6 320 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 NDC1Q9BTX1 674 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 SLC46A2Q9BY10 475 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 ACKR4Q9NPB9 350 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 TM7SF3Q9NS93 570 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 SEMA4GQ9NTN9 838 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 TAAR2Q9P1P5 351 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 A0A1W2PRQ8 180 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 GXYLT2A0PJZ3 443 aa7.52□□□□□ -1.21
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