RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607519.1

GMDS-AS1-216, humanhuman

TSL 4

Gene GMDS-AS1, Length 579 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ZNF610Q8N9Z0 462 aa9.31□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LRRC75AQ8NAA5 344 aa9.31□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 AQP11Q8NBQ7 271 aa9.31□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ICA1LQ8NDH6 482 aa9.31□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 OR10G2Q8NGC3 310 aa9.31□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa9.31□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 OXGR1Q96P68 337 aa9.31□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 YY1AP1Q9H869 796 aa9.31□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MED29Q9NX70 200 aa9.31□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PRSS50Q9UI38 385 aa9.31□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ZNF229Q9UJW7 825 aa9.31□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa9.31□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PKDREJQ9NTG1 2253 aa9.31□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa9.3□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 HSPB2A8KAH6 182 aa9.3□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RNF13O43567 381 aa9.3□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP9.3□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 AGFG2O95081 481 aa9.3□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 OR6A2O95222 327 aa9.3□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MT-ATP6P00846 226 aa9.3□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CGAP01215 116 aa9.3□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TP53P04637 393 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 IFNGR1P15260 489 aa9.3□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 AGTR1P30556 359 aa9.3□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 UQCRC1P31930 480 aa9.3□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SELENOPP49908 381 aa9.3□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DAPP51397 102 aa9.3□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SLC16A1P53985 500 aa9.3□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ERVK-25P63136 954 aa9.3□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RUNX1T1Q06455 604 aa9.3□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PUDPQ08623 228 aa9.3□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ZP4Q12836 540 aa9.3□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 C1DQ13901 141 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MELKQ14680 651 aa9.3□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 HSPB2Q16082 182 aa9.3□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ZBED5Q49AG3 693 aa9.3□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PHYHD1Q5SRE7 291 aa9.3□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CARD17Q5XLA6 110 aa9.3□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FAM214BQ7L5A3 538 aa9.3□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa9.3□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 OAFQ86UD1 273 aa9.3□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CDK20Q8IZL9 346 aa9.3□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SLC43A2Q8N370 569 aa9.3□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SCAIQ8N9R8 606 aa9.3□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 OR5K1Q8NHB7 308 aa9.3□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LIPHQ8WWY8 451 aa9.3□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SAMD8Q96LT4 415 aa9.3□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 EGLN3Q9H6Z9 239 aa9.3□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 BCO1Q9HAY6 547 aa9.3□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RASD1Q9Y272 281 aa9.3□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SIGLEC7Q9Y286 467 aa9.3□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa9.3□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CORINQ9Y5Q5 1042 aa9.3□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CLEC18AA5D8T8 446 aa9.29□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 WIPF3A6NGB9 483 aa9.29□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ZNF724A8MTY0 619 aa9.29□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MCIDASD6RGH6 385 aa9.29□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 IMPA2O14732 288 aa9.29□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RRP9O43818 475 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 UPK3AO75631 287 aa9.29□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 IGF2P01344 180 aa9.29□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TSPAN19P0C672 248 aa9.29□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FCGR2AP12318 317 aa9.29□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ZNF43P17038 809 aa9.29□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 GRNP28799 593 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CTXN1P60606 82 aa9.29□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TSPAN31Q12999 210 aa9.29□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CAMK2DQ13557 499 aa9.29□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MFSD13AQ14CX5 517 aa9.29□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PDK3Q15120 406 aa9.29□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RCN1Q15293 331 aa9.29□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TSC22D1Q15714 1073 aa9.29□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TMEM201Q5SNT2 666 aa9.29□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa9.29□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 OR2A2Q6IF42 318 aa9.29□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ZFP1Q6P2D0 407 aa9.29□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NIPAL3Q6P499 406 aa9.29□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CLEC18BQ6UXF7 455 aa9.29□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SLC35D2Q76EJ3 337 aa9.29□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LINGO2Q7L985 606 aa9.29□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 AAED1Q7RTV5 226 aa9.29□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 GALNT5Q7Z7M9 940 aa9.29□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LUZP2Q86TE4 346 aa9.29□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa9.29□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 STK32CQ86UX6 486 aa9.29□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 UEVLDQ8IX04 471 aa9.29□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CLDN22Q8N7P3 220 aa9.29□□□□□ -0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CLEC18CQ8NCF0 446 aa9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.5 ms