RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563951.1

CCDC33-211, Transcript of coiled-coil domain containing 33, humanhuman

TSL 5

Gene CCDC33, Length 308 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33-211ENST00000563951 C9orf135Q5VTT2 229 aa7.5□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 PAMR1Q6UXH9 720 aa7.5□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 WFDC8Q8IUA0 241 aa7.5□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 ZNF100Q8IYN0 542 aa7.5□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 DEFB107AQ8IZN7 70 aa7.5□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 OFCC1Q8IZS5 231 aa7.5□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 TMEM123Q8N131 208 aa7.5□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 SCAIQ8N9R8 606 aa7.5□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 CCDC197Q8NCU1 140 aa7.5□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 STEAP2Q8NFT2 490 aa7.5□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 MPP4Q96JB8 637 aa7.5□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 OXGR1Q96P68 337 aa7.5□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 EPYCQ99645 322 aa7.5□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 TMEM204Q9BSN7 226 aa7.5□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa7.5□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 NELFAQ9H3P2 528 aa7.5□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 FANCFQ9NPI8 374 aa7.5□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 NDRG3Q9UGV2 375 aa7.5□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 RIMS3Q9UJD0 308 aa7.5□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa7.5□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 MTORP42345 2549 aa7.49□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 ITPR3Q14573 2671 aa7.49□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 A0A1W2PR80 420 aa7.49□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 NDUFAB1O14561 156 aa7.49□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 ARPC2O15144 300 aa7.49□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 GSTA4O15217 222 aa7.49□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 CH25HO95992 272 aa7.49□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 IFNA14P01570 189 aa7.49□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 PPP3CBP16298 524 aa7.49□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 FUT1P19526 365 aa7.49□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 ATP6V1B2P21281 511 aa7.49□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 VLDLRP98155 873 aa7.49□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 FAPQ12884 760 aa7.49□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 FHL1Q13642 323 aa7.49□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 TESK1Q15569 626 aa7.49□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 GABRA6Q16445 453 aa7.49□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 IFI44LQ53G44 452 aa7.49□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 TMEM225Q6GV28 225 aa7.49□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 GLYATQ6IB77 296 aa7.49□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 NIPAL3Q6P499 406 aa7.49□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 RINLQ6ZS11 566 aa7.49□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 AAED1Q7RTV5 226 aa7.49□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 WDR31Q8NA23 367 aa7.49□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 OR5J2Q8NH18 312 aa7.49□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 FAM162AQ96A26 154 aa7.49□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 PIK3IP1Q96FE7 263 aa7.49□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 TXNDC15Q96J42 360 aa7.49□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 C7orf34Q96L11 122 aa7.49□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 OR2M2Q96R28 347 aa7.49□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 CDRT15Q96T59 188 aa7.49□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 SLC19A3Q9BZV2 496 aa7.49□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 FKRPQ9H9S5 495 aa7.49□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 ASB6Q9NWX5 421 aa7.49□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 MED29Q9NX70 200 aa7.49□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa7.49□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 TAS2R16Q9NYV7 291 aa7.49□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 ADA2Q9NZK5 511 aa7.49□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 SELENONQ9NZV5 590 aa7.49□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 RHCGQ9UBD6 479 aa7.49□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 RCE1Q9Y256 329 aa7.49□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa7.49□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 CORINQ9Y5Q5 1042 aa7.49□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 SLC25A15Q9Y619 301 aa7.49□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 V9GYQ6 96 aa7.49□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 USF3Q68DE3 2245 aa7.49□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 ACANP16112 2415 aa7.49□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa7.48□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 DPRXA6NFQ7 191 aa7.48□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 OR5H1A6NKK0 313 aa7.48□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 OR7A10O76100 309 aa7.48□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 ATE1O95260 518 aa7.48□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 MT-ATP6P00846 226 aa7.48□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 IGF2P01344 180 aa7.48□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 MT-ND1P03886 318 aa7.48□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 IFNW1P05000 195 aa7.48□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 TSPAN19P0C672 248 aa7.48□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 THRBP10828 461 aa7.48□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 ZNF43P17038 809 aa7.48□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 RBM34P42696 430 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 PUDPQ08623 228 aa7.48□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 SPOCK1Q08629 439 aa7.48□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 PMS2P3Q13401 168 aa7.48□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 MFSD13AQ14CX5 517 aa7.48□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 STK11Q15831 433 aa7.48□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 BEX5Q5H9J7 111 aa7.48□□□□□ -1.21
CCDC33-211ENST00000563951 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.6 ms