RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		4.01	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		4.01	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	PTOV1	Q86YD1	416 aa		4.01	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	C10orf111	Q8N326	155 aa		4.01	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	KIF2B	Q8N4N8	673 aa		4.01	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		4.01	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	PLPP5	Q8NEB5	264 aa		4.01	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		4.01	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	OR9A2	Q8NGT5	310 aa		4.01	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	GOT1L1	Q8NHS2	421 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	OR5P2	Q8WZ92	322 aa		4.01	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	STARD8	Q92502	1023 aa		4.01	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	TSLP	Q969D9	159 aa		4.01	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	LRRC58	Q96CX6	371 aa		4.01	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	AURKB	Q96GD4	344 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	RBM18	Q96H35	190 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	ITCH	Q96J02	903 aa		4.01	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF583	Q96ND8	569 aa		4.01	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC115	Q96NT0	180 aa		4.01	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	AMDHD1	Q96NU7	426 aa		4.01	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	PANX1	Q96RD7	426 aa		4.01	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		4.01	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	GPATCH1	Q9BRR8	931 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	DDA1	Q9BW61	102 aa		4.01	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	ULBP3	Q9BZM4	244 aa		4.01	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		4.01	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	ANKRA2	Q9H9E1	313 aa		4.01	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	NANOG	Q9H9S0	305 aa		4.01	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	WDR41	Q9HAD4	459 aa		4.01	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	MRGBP	Q9NV56	204 aa		4.01	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	FAM120C	Q9NX05	1096 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	NKIRAS2	Q9NYR9	191 aa		4.01	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		4.01	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	VAPA	Q9P0L0	249 aa		4.01	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF282	Q9UDV7	671 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	BTNL2	Q9UIR0	455 aa		4.01	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	LEF1	Q9UJU2	399 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	PSME2	Q9UL46	239 aa		4.01	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	PPIE	Q9UNP9	301 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	NEUROG3	Q9Y4Z2	214 aa		4.01	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF780B	Q9Y6R6	833 aa		4.01	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	SPACA6	W5XKT8	324 aa		4.01	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934		A0A096LPI6	279 aa		4	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	IGKV3D-11	A0A0A0MRZ8	115 aa		4	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	hCG_1809904	A0A1W2PP81	198 aa		4	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934		A0A1W2PPE2	198 aa		4	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934		A0A1W2PR64	198 aa		4	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934		A0A1W2PS18	150 aa		4	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	IDS	B3KWA1	339 aa		4	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	DVL1	O14640	695 aa		4	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	GYG2	O15488	501 aa		4	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	SSX4	O60224	188 aa		4	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	ATP5H	O75947	161 aa		4	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	TPO	P07202	933 aa		4	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	KRT16	P08779	473 aa		4	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	CT62	P0C5K7	136 aa		4	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	ZCCHC18	P0CG32	403 aa		4	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	SLC35E2	P0CK97	266 aa		4	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	TNNI3	P19429	210 aa		4	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	TCN2	P20062	427 aa		4	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	NT5E	P21589	574 aa		4	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	IL10	P22301	178 aa		4	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	PTPN4	P29074	926 aa		4	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	RBMS1	P29558	406 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	MPI	P34949	423 aa		4	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	CCT3	P49368	545 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	NUDT2	P50583	147 aa		4	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	GZMM	P51124	257 aa		4	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	MNAT1	P51948	309 aa		4	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	NCBP2	P52298	156 aa	Known RBP eCLIP	4	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	DVL1P1	P54792	670 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	EMP2	P54851	167 aa		4	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	HSD17B7	P56937	341 aa		4	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	KCNJ2	P63252	427 aa		4	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	STX4	Q12846	297 aa		4	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	HSPB3	Q12988	150 aa		4	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	GAGE2B	Q13066	116 aa		4	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	TGIF1	Q15583	401 aa		4	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	LTB4R	Q15722	352 aa		4	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	NSDHL	Q15738	373 aa		4	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		4	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	GAGE2E	Q4V326	116 aa		4	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	TRMT12	Q53H54	448 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		4	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		4	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM211	Q6ICI0	200 aa		4	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	OR52E8	Q6IFG1	317 aa		4	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		4	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		4	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		4	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		4	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	MSANTD1	Q6ZTZ1	278 aa		4	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	ASRGL1	Q7L266	308 aa		4	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	C6orf120	Q7Z4R8	191 aa		4	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF595	Q8IYB9	648 aa		4	□□□□□ -1.77

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