RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522344.1

CPEB4-210, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene CPEB4, Length 481 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB4-210ENST00000522344 CASC10Q5T4H9 136 aa2.41□□□□□ -2.02
CPEB4-210ENST00000522344 UNC5DQ6UXZ4 953 aa2.41□□□□□ -2.02
CPEB4-210ENST00000522344 RFLNAQ6ZTI6 216 aa2.41□□□□□ -2.02
CPEB4-210ENST00000522344 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa2.41□□□□□ -2.02
CPEB4-210ENST00000522344 OR52B4Q8NGK2 314 aa2.41□□□□□ -2.02
CPEB4-210ENST00000522344 NANPQ8TBE9 248 aa2.41□□□□□ -2.02
CPEB4-210ENST00000522344 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
CPEB4-210ENST00000522344 C14orf79Q96F83 325 aa2.41□□□□□ -2.02
CPEB4-210ENST00000522344 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP2.41□□□□□ -2.02
CPEB4-210ENST00000522344 SPXQ9BT56 116 aa2.41□□□□□ -2.02
CPEB4-210ENST00000522344 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
CPEB4-210ENST00000522344 VCPKMTQ9H867 229 aa2.41□□□□□ -2.02
CPEB4-210ENST00000522344 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
CPEB4-210ENST00000522344 TBX21Q9UL17 535 aa2.41□□□□□ -2.02
CPEB4-210ENST00000522344 NLRC5Q86WI3 1866 aa2.41□□□□□ -2.02
CPEB4-210ENST00000522344 TANC1Q9C0D5 1861 aa2.41□□□□□ -2.02
CPEB4-210ENST00000522344 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa2.41□□□□□ -2.02
CPEB4-210ENST00000522344 BDP1A6H8Y1 2624 aa2.4□□□□□ -2.02
CPEB4-210ENST00000522344 DOCK5Q9H7D0 1870 aa2.4□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 VSTM2BA6NLU5 285 aa2.4□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 E7ESA3 106 aa2.4□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 PRKYO43930 277 aa2.4□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 B3GAT3O94766 335 aa2.4□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 OPN1LWP04000 364 aa2.4□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 IGKV5-2P06315 115 aa2.4□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 FUT1P19526 365 aa2.4□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 RPS12P25398 132 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 CD80P33681 288 aa2.4□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 PRKXP51817 358 aa2.4□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 NUCB2P80303 420 aa2.4□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 CEBPEQ15744 281 aa2.4□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 C12orf60Q5U649 245 aa2.4□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 COX15Q7KZN9 410 aa2.4□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 DPY19L4Q7Z388 723 aa2.4□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP2.4□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP2.4□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 MFSD6LQ8IWD5 586 aa2.4□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 SVOPLQ8N434 492 aa2.4□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 NKAPP1Q8N9T2 125 aa2.4□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 OR56B4Q8NH76 319 aa2.4□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 OR6X1Q8NH79 312 aa2.4□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 SLC22A8Q8TCC7 542 aa2.4□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa2.4□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 CEP170P1Q96L14 293 aa2.4□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 SLC6A7Q99884 636 aa2.4□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP2.4□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 ECT2Q9H8V3 914 aa2.4□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 ATXN10Q9UBB4 475 aa2.4□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 ALG6Q9Y672 507 aa2.4□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 V9GY05 133 aa2.4□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 TET1Q8NFU7 2136 aa2.39□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 RFX7Q2KHR2 1363 aa2.39□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 MYH7BA7E2Y1 1941 aa2.39□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa2.39□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 A6NIZ1 184 aa2.39□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 LAD1O00515 517 aa2.39□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 RASGRF2O14827 1237 aa2.39□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 OR4F21O95013 312 aa2.39□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 MT-ND3P03897 115 aa2.39□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 CRISP2P16562 243 aa2.39□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 CYP2B6P20813 491 aa2.39□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 ANXA13P27216 316 aa2.39□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 HOXA9P31269 272 aa2.39□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 LEPP41159 167 aa2.39□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 KLK7P49862 253 aa2.39□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 RAP1BP61224 184 aa2.39□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa2.39□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 NIPAL3Q6P499 406 aa2.39□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 GCNT2Q8N0V5 402 aa2.39□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 OR51S1Q8NGJ8 323 aa2.39□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 SELENOMQ8WWX9 145 aa2.39□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 NGBQ9NPG2 151 aa2.39□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa2.39□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 C5orf42Q9H799 3197 aa2.39□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 SIP14410 1827 aa2.39□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 KIAA1671Q9BY89 1806 aa2.39□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 TRIOO75962 3097 aa2.38□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 LAMA4Q16363 1823 aa2.38□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa2.38□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 A0A1B0GUL7 405 aa2.38□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 CLRN2A0PK11 232 aa2.38□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 SERPINE3A8MV23 424 aa2.38□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 SPAG7O75391 227 aa2.38□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 MBD3O95983 291 aa2.38□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 CA1P00915 261 aaPredicted RBP2.38□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 CHTF8P0CG12 524 aa2.38□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP2.38□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 ICAM2P13598 275 aa2.38□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 ATP6V1E1P36543 226 aa2.38□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 RABIFP47224 123 aa2.38□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF136P52737 540 aa2.38□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP2.38□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 PSG5Q15238 335 aa2.38□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 C1orf100Q5SVJ3 147 aa2.38□□□□□ -2.03
CPEB4-210ENST00000522344 FAM71E1Q6IPT2 247 aa2.38□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.5 ms