RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495588.2

GAPVD1-218, Transcript of GTPase activating protein and VPS9 domains 1, human

TSL 5

Gene GAPVD1, Length 274 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GAPVD1-218	ENST00000495588	TRIM45	Q9H8W5	580 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GAPVD1-218	ENST00000495588	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GAPVD1-218	ENST00000495588	CACYBP	Q9HB71	228 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GAPVD1-218	ENST00000495588	S100A14	Q9HCY8	104 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GAPVD1-218	ENST00000495588	SH2D2A	Q9NP31	389 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GAPVD1-218	ENST00000495588	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GAPVD1-218	ENST00000495588	TEKT2	Q9UIF3	430 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GAPVD1-218	ENST00000495588	IFT52	Q9Y366	437 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GAPVD1-218	ENST00000495588	AP4S1	Q9Y587	144 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GAPVD1-218	ENST00000495588	SPTBN2	O15020	2390 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GAPVD1-218	ENST00000495588		B4DXG7	233 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588		G3V3Y1	287 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	AP3D1	O14617	1153 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	TP53I11	O14683	189 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	FFAR1	O14842	300 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	MGST3	O14880	152 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	GMFG	O60234	142 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	CEACAM4	O75871	244 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	NEURL1	O76050	574 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	ATP6V1G2	O95670	118 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	IFNW1	P05000	195 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	UBL4A	P11441	157 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	PRG2	P13727	222 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	HTR2A	P28223	471 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	GRK5	P34947	590 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	CASP3	P42574	277 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	ACAA2	P42765	397 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	CYB561	P49447	251 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	HLCS	P50747	726 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	ZNF136	P52737	540 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	RGS8	P57771	180 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	OC90	Q02509	493 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	ZNF117	Q03924	483 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	SKP2	Q13309	424 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	MFAP5	Q13361	173 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	RIPK1	Q13546	671 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	OR1C1	Q15619	314 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	EIPR1	Q53HC9	387 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	AGAP7P	Q5VUJ5	663 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	SLC22A10	Q63ZE4	541 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	SPINK14	Q6IE38	97 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	OR5M10	Q6IEU7	315 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	ZFP1	Q6P2D0	407 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	TMEM81	Q6P7N7	255 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	RTL4	Q6ZR62	310 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	GRAMD2A	Q8IUY3	354 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	ZDHHC21	Q8IVQ6	265 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	GPALPP1	Q8IXQ4	340 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	DND1	Q8IYX4	353 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	CYP4Z2P	Q8N1L4	340 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	PAQR8	Q8TEZ7	354 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	PHF10	Q8WUB8	498 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	POP5	Q969H6	163 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	ZNF524	Q96C55	264 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	AGAP4	Q96P64	663 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	SIGLEC12	Q96PQ1	595 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	PKP2	Q99959	881 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	KLHDC3	Q9BQ90	382 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	OSBPL11	Q9BXB4	747 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	HES7	Q9BYE0	225 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	ARMC7	Q9H6L4	198 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	METTL7A	Q9H8H3	244 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	PROK2	Q9HC23	129 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	IL1RAP	Q9NPH3	570 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	CTPS2	Q9NRF8	586 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	AGPAT4	Q9NRZ5	378 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	DEPP	Q9NTK1	212 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	KLHL28	Q9NXS3	571 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	KLRF1	Q9NZS2	232 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	ABI3	Q9P2A4	366 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	SLC35A3	Q9Y2D2	325 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	CARD8	Q9Y2G2	431 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	NTNG1	Q9Y2I2	539 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	WIF1	Q9Y5W5	379 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	ENPP4	Q9Y6X5	453 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	NIN	Q8N4C6	2090 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	HEATR5A	Q86XA9	2040 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	TNRC6A	Q8NDV7	1962 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588		A0A087WV48	116 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588		A0A0G2JMM0	328 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588		A0A1W2PPB8	328 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588		A0A1W2PRS3	328 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	OR5H15	A6NDH6	313 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	LRRC3C	A6NJW4	275 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	CPSF4L	A6NMK7	179 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	KIR3DP1	A8MWS1	328 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588		H3BNH8	94 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	CLOCK	O15516	846 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	ZNF264	O43296	627 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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